RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616449.1

ACSS3-208, Transcript of acyl-CoA synthetase short chain family member 3, human

Gene ACSS3, Length 3,833 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACSS3-208	ENST00000616449	MRPL40	Q9NQ50	206 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RRN3	Q9NYV6	651 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZCWPW2	A0A1B0GU75	182 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	IRAK2	O43187	625 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP3K13	O43283	966 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	VPS26A	O75436	327 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SATB1	Q01826	763 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TUSC3	Q13454	348 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CDH18	Q13634	790 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TSN	Q15631	228 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	POTEH	Q6S545	545 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SZRD1	Q7Z422	152 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CCDC126	Q96EE4	140 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PRKD2	Q9BZL6	878 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	DRC3	Q9H069	523 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HPS4	Q9NQG7	708 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	STK39	Q9UEW8	545 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TBKBP1	A7MCY6	615 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PTGES3L	E9PB15	166 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ENPP3	O14638	875 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MATN3	O15232	486 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CLOCK	O15516	846 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CDK18	Q07002	472 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GK3P	Q14409	553 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TAZ	Q16635	292 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	AAGAB	Q6PD74	315 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PAQR9	Q6ZVX9	377 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MAVS	Q7Z434	540 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	LZTR1	Q8N653	840 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHB9	Q9Y5E1	797 aa		12.79	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449		A0A1W2PQ67	120 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SYCE1L	A8MT33	242 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449		A8MT66	165 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PIP5K1B	O14986	540 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TNFAIP8	O95379	198 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CRTAM	O95727	393 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GOT2	P00505	430 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ARRB2	P32121	409 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNQ1	P51787	676 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	RHOA	P61586	193 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CREB5	Q02930	508 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CEACAM7	Q14002	265 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SPRYD7	Q5W111	196 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GPR21	Q99679	349 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449		U3KQV3	271 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	IQCF5	A8MTL0	148 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CAPN14	A8MX76	684 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PPP6C	O00743	305 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ARSD	P51689	593 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TRAF2	Q12933	501 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PLD1	Q13393	1074 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	DPYS	Q14117	519 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNA10	Q16322	511 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	REP15	Q6BDI9	236 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ZNF280B	Q86YH2	543 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	B4GALNT2	Q8NHY0	566 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	FAM162A	Q96A26	154 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	C19orf60	Q96EN9	201 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SOX17	Q9H6I2	414 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	GKN1	Q9NS71	199 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MATN2	O00339	956 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	ALB	P02768	609 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CKM	P06732	381 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	KCNA5	P22460	613 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	SLC11A2	P49281	568 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	CCL23	P55773	120 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	MS4A2	Q01362	244 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	TRIM32	Q13049	653 aa		12.78	□□□□□ -0.36
ACSS3-208	ENST00000616449	PKDCC	Q504Y2	493 aa		12.78	□□□□□ -0.36

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