RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRK2	Q5S007	2527 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MX80	341 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP6	O43182	974 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGB2	P05107	769 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ELFN1	P0C7U0	828 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINA4	P29622	427 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	STAT1	P42224	750 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARSD	P51689	593 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MAPK10	P53779	464 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALNT1	Q00973	533 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	GRM3	Q14832	879 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SYCP1	Q15431	976 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PHF19	Q5T6S3	580 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DPPA4	Q7L190	304 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SRL	Q86TD4	932 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	USP7	Q93009	1102 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PEBP4	Q96S96	227 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM117A	Q9C073	453 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR26	Q9H7D7	661 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		11.98	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PRSS38	A1L453	326 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CFAP69	A5D8W1	941 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFRSF10C	O14798	259 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GAT1	O43505	415 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FUCA1	P04066	466 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CCL4	P13236	92 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PNLIP	P16233	465 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM23	P36406	574 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CSNK1D	P48730	415 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CSRP3	P50461	194 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NDST2	P52849	883 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	AIF1	P55008	147 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TBR1	Q16650	682 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MAP9	Q49MG5	647 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MANEA	Q5SRI9	462 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	AFMID	Q63HM1	303 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NRROS	Q86YC3	692 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD15	Q96SI1	283 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CMKLR1	Q99788	373 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF3C3	Q9Y5Q9	886 aa		11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	11.97	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TEX33	O43247	280 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PALM	O75781	387 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	OR1D5	P58170	312 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGEF7	Q14155	803 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CLCA4	Q14CN2	919 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CNGA3	Q16281	694 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	AMZ1	Q400G9	498 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PNCK	Q6P2M8	343 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM159	Q96B96	161 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	COQ10A	Q96MF6	247 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	AGPAT1	Q99943	283 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP9	Q9BRR9	750 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SNRNP25	Q9BV90	132 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CINP	Q9BW66	212 aa	Predicted RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM7	Q9C029	511 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	SP110	Q9HB58	689 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17B	Q9UHF5	180 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		11.96	□□□□□ -0.49
TTLL3-233	ENST00000602338	NBAS	A2RRP1	2371 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQC6	194 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD62	A6NC57	917 aa		11.95	□□□□□ -0.5
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP42	A6NI28	874 aa		11.95	□□□□□ -0.5

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