RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590638.5

NEDD4L-230, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD4L, Length 862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-230ENST00000590638 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 PEX26Q7Z412 305 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 DEFB128Q7Z7B8 93 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 COLGALT2Q8IYK4 626 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 WDTC1Q8N5D0 677 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC15A4Q8N697 577 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CEP112Q8N8E3 955 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TMIEQ8NEW7 156 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MYRIPQ8NFW9 859 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 KLHL32Q96NJ5 620 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CASD1Q96PB1 797 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 C11orf70Q9BRQ4 267 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SELENOOQ9BVL4 669 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TLR10Q9BXR5 811 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SERHLQ9NQF3 203 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 PARVAQ9NVD7 372 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TBC1D13Q9NVG8 400 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TSPAN16Q9UKR8 245 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SNX12Q9UMY4 172 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 COG5Q9UP83 839 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CDYLQ9Y232 598 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 LRCH1Q9Y2L9 728 aa8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 M0QZQ0 153 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CES2O00748 559 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 DDHD2O94830 711 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TYMPP19971 482 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 LMO2P25791 158 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC1A1P43005 524 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 GPD2P43304 727 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 GABRB2P47870 512 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 OR1G1P47890 313 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MAN2A2P49641 1150 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 GSCP56915 257 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SLC8A3P57103 927 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 RPS16P62249 146 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TUBB4BP68371 445 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 NHLH2Q02577 135 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF844Q08AG5 666 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CTBP1Q13363 440 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MESDQ14696 234 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 NT5DC3Q86UY8 548 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF280BQ86YH2 543 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 THEM5Q8N1Q8 247 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM199Q8N511 208 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 C12orf29Q8N999 325 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ANKRD52Q8NB46 1076 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MNS1Q8NEH6 495 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 C18orf8Q96DM3 657 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 PBKQ96KB5 322 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MSLNLQ96KJ4 702 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 OSBPL9Q96SU4 736 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MNTQ99583 582 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SMOQ99835 787 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 PAAF1Q9BRP4 392 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TMEM175Q9BSA9 504 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 VPS11Q9H270 941 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SYNCQ9H7C4 482 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 FNIP2Q9P278 1114 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 RNF14Q9UBS8 474 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 CDH9Q9ULB4 789 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 NME7Q9Y5B8 376 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ALG6Q9Y672 507 aa8.05□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 LTBP2Q14767 1821 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 FAM170AA1A519 330 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SIGLEC16A6NMB1 481 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 F5H423 210 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 APOL1O14791 398 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 TADA2AO75478 443 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 PAFAH1B1P43034 410 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 ACADSBP45954 432 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 BRCC3P46736 316 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 BCAT1P54687 386 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 SATB1Q01826 763 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 BST2Q10589 180 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 PDCLQ13371 301 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MAMLD1Q13495 774 aa8.04□□□□□ -1.12
NEDD4L-230ENST00000590638 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms