RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM196Q5HYL7 178 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC30BQ8N4P2 665 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HEBP1Q9NRV9 189 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SENP1Q9P0U3 644 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HCN2Q9UL51 889 aa31.12■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EQS6 105 aa31.11■■■□□ 2.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 KRT38O76015 456 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ABL2P42684 1182 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR63Q9BZJ6 419 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MFSD1Q9H3U5 465 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TBK1Q9UHD2 729 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ACTL7BQ9Y614 415 aa31.11■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC78A2IDD5 438 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KRT37O76014 449 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CTSLP07711 333 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HLA-EP13747 358 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ARNTP27540 789 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP31.1■■■□□ 2.57
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CAPNS1-206ENST00000588815 TXNDC11Q6PKC3 985 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TPRG1Q6ZUI0 275 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZSWIM9Q86XI8 627 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF366Q8N895 744 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MTBPQ96DY7 904 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 STON1Q9Y6Q2 735 aa31.1■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHX1P07099 455 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ASGR2P07307 311 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 GP5P40197 560 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 UGP2Q16851 508 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 GRTP1Q5TC63 336 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD16Q68DU8 428 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KIAA0408Q6ZU52 694 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 STK40Q8N2I9 435 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SGSM3Q96HU1 749 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 MTG2Q9H4K7 406 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1HQ9ULR3 514 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PKP3Q9Y446 797 aa31.09■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 H7C0S8 307 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 STX7O15400 261 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PIAS1O75925 651 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CTPS1P17812 591 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HNF1BP35680 557 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 NEPROQ6NW34 567 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CHPFQ8IZ52 775 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 HDAC10Q969S8 669 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP1R16AQ96I34 528 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 KCTD3Q9Y597 815 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 AURKAO14965 403 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 ALPIP09923 528 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IL9P15248 144 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 SUOXP51687 545 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 PACS1Q6VY07 963 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 GALNT7Q86SF2 657 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4K2Q8NGD2 314 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 OR13C4Q8NGS5 318 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 IL17CQ9P0M4 197 aa31.08■■■□□ 2.57
CAPNS1-206ENST00000588815 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa31.07■■■□□ 2.56
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CAPNS1-206ENST00000588815 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa31.07■■■□□ 2.56
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CAPNS1-206ENST00000588815 PON2Q15165 354 aa31.07■■■□□ 2.56
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CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4X1Q8N118 509 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 TBATAQ96M53 351 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM129BQ96TA1 746 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 FBRSQ9HAH7 460 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS16Q9NQE7 514 aa31.07■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
CAPNS1-206ENST00000588815 SPRP35270 261 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
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