RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586792.5

ZNF540-204, Transcript of zinc finger protein 540, human

TSL 3 BASIC

Gene ZNF540, Length 564 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF540-204	ENST00000586792	BFSP1	Q12934	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TRPC3	Q13507	836 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	VEPH1	Q14D04	833 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SNRNP35	Q16560	246 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	KNOP1	Q1ED39	458 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ZBTB41	Q5SVQ8	909 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CFAP58	Q5T655	872 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TPGS2	Q68CL5	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SDCCAG8	Q86SQ7	713 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ZNF461	Q8TAF7	563 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SH3KBP1	Q96B97	665 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SARAF	Q96BY9	339 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	PAGE5	Q96GU1	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	GCNA	Q96QF7	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	BARD1	Q99728	777 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ABCG4	Q9H172	646 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	S1PR5	Q9H228	398 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CXCL16	Q9H2A7	254 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	MFSD1	Q9H3U5	465 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	BRD9	Q9H8M2	597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	B4GALT6	Q9UBX8	382 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	MUTYH	Q9UIF7	546 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ZFP37	Q9Y6Q3	630 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	DENND4A	Q7Z401	1863 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TCHH	Q07283	1943 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TSC2	P49815	1807 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	WDR27	A2RRH5	827 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC151	A5D8V7	595 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	C2CD4D	B7Z1M9	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	RASA4B	C9J798	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792		M0QZQ0	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CYB561D2	O14569	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TPP1	O14773	563 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	AREL1	O15033	823 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CLIC2	O15247	247 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	PJA2	O43164	708 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	RASA4	O43374	803 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	FAM189A1	O60320	539 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	JMJD7	P0C870	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	KRT13	P13646	458 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TYMP	P19971	482 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CD40	P25942	277 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CASP1	P29466	404 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ADSS	P30520	456 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	AP3M2	P53677	418 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	LILRA4	P59901	499 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	TNNC1	P63316	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CXADR	P78310	365 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	RBP5	P82980	135 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	MGAT5	Q09328	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	STIM1	Q13586	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	BLMH	Q13867	455 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SLMAP	Q14BN4	828 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ZBTB6	Q15916	424 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	PABPC1L	Q4VXU2	614 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	HECTD3	Q5T447	861 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	MTSS1L	Q765P7	747 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	GLB1L2	Q8IW92	636 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	SAMD14	Q8IZD0	417 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	LEMD2	Q8NC56	503 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ZNF540-204	ENST00000586792	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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