RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585907.1

PRKAR1A-209, Transcript of protein kinase cAMP-dependent type I regulatory subunit alpha, human

TSL 2

Gene PRKAR1A, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	IL18BP	O95998	194 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CALCA	P01258	141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	IGLV3-19	P01714	112 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CAPNS1	P04632	268 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SOX5	P35711	763 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	P2RY2	P41231	377 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DPP6	P42658	865 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MATK	P42679	507 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PLK1	P53350	603 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	LIMK1	P53667	647 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PPP2R2A	P63151	447 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ARHGAP8	P85298	464 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	KDSR	Q06136	332 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC12A1	Q13621	1099 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CSRP2	Q16527	193 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PLK5	Q496M5	336 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PTPN20	Q4JDL3	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EMC10	Q5UCC4	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907		Q6ZSN1	163 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	USP53	Q70EK8	1073 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CREBRF	Q8IUR6	639 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SFTPA1	Q8IWL2	248 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ALLC	Q8N6M5	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	UCMA	Q8WVF2	138 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TTC17	Q96AE7	1141 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NPY6R	Q99463	290 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ARPC5L	Q9BPX5	153 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	VPS16	Q9H269	839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ST7	Q9NRC1	585 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NCDN	Q9UBB6	729 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PPARGC1A	Q9UBK2	798 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	RAB23	Q9ULC3	237 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CEP83	Q9Y592	693 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ITIH6	Q6UXX5	1313 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CAPN9	O14815	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	EPHB6	O15197	1021 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PDPK1	O15530	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	F9	P00740	461 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	APOE	P02649	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ASL	P04424	464 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ERBB2	P04626	1255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HMBS	P08397	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	COL6A2	P12110	1019 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HOXB2	P14652	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CHRNB2	P17787	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	GABRG2	P18507	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	MMP8	P22894	467 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	ACRV1	P26436	265 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HLA-F	P30511	346 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HOXC13	P31276	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SLC6A4	P31645	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CCR1	P32246	355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	HOXD12	P35452	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	USP8	P40818	1118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	STAT1	P42224	750 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CXCR3	P49682	368 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	NOMO3	P69849	1222 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	DGCR2	P98153	550 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CDK17	Q00537	523 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	CDR2	Q01850	454 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	IQCB1	Q15051	598 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PRKAR1A-209	ENST00000585907	SYCP1	Q15431	976 aa		4.95	□□□□□ -1.62

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