RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCNDBP1-211ENST00000567434 RBFAQ8N0V3 343 aa17.12■□□□□ 0.33
CCNDBP1-211ENST00000567434 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
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CCNDBP1-211ENST00000567434 DTD2Q96FN9 168 aa17.12■□□□□ 0.33
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