RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL4A6Q14031 1691 aa21.39■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8OA6NCC3 632 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C2orf81A6NN90 581 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GOLGA8NF8WBI6 632 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMG1O95456 288 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COX4I1P13073 169 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PSMA3P25788 255 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCR10P46092 362 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC6Q16204 474 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TYSND1Q2T9J0 566 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 POU5F2Q8N7G0 328 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 OR13C4Q8NGS5 318 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR60Q8WVS4 1066 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRGBPQ9NV56 204 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACTL7AQ9Y615 435 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 A8MT66 165 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H0Y3Z8 333 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZBTB14O43829 449 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 THRAP10827 490 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RGRP47804 291 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SUOXP51687 545 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STC1P52823 247 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CREMQ03060 361 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C16orf59Q7L2K0 433 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR65Q8IYL9 337 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PHTF2Q8N3S3 785 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KDM1BQ8NB78 822 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TCF12Q99081 682 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RTKNQ9BST9 563 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TRMOQ9BU70 441 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NUF2Q9BZD4 464 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRYL1Q9Y2S2 319 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INSL5Q9Y5Q6 135 aa21.38■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MEI4A8MW99 385 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NEMP1O14524 444 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C1RP00736 705 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIRTP0C851 137 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GCKP35557 465 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SATB1Q01826 763 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RCN1Q15293 331 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ANKRD49Q8WVL7 239 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MOCOSQ96EN8 888 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACSS2Q9NR19 701 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RAI2Q9Y5P3 530 aa21.37■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 H0Y626 953 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PFDN6O15212 129 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EFCAB14O75071 495 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMIM24O75264 130 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RALGPS1Q5JS13 557 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPR158Q5T848 1215 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMPD4Q9NXE4 827 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GTSE1Q9NYZ3 720 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK39Q9UEW8 545 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC7A8Q9UHI5 535 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SPO11Q9Y5K1 396 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TBL1XO60907 577 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC4A1P02730 911 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 F11P03951 625 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EPHA3P29320 983 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC25A3Q00325 362 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NFKB2Q00653 900 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PTPRCAPQ14761 206 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF549Q6P9A3 640 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CARNMT1Q8N4J0 409 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LPCAT1Q8NF37 534 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ACTRT2Q8TDY3 377 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EXOC2Q96KP1 924 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ASB3Q9Y575 518 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms