RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559463.5

RPL28-208, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPL28, Length 852 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-208ENST00000559463 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 NDUFA10O95299 355 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 PDHA1P08559 390 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 CKMT2P17540 419 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 ACP1P24666 158 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 CDKN2BP42772 138 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 MARCKSL1P49006 195 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 PEX5P50542 639 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 CLDN6P56747 220 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 NIPAL4Q0D2K0 466 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 ZBTB17Q13105 803 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 MTM1Q13496 603 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 NFATC4Q14934 902 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 ST3GAL2Q16842 350 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 ARMC12Q5T9G4 340 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 TSPAN33Q86UF1 283 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 RFX6Q8HWS3 928 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 CCNYQ8ND76 341 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 COQ10AQ96MF6 247 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 IL12RB2Q99665 862 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 APOOQ9BUR5 198 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 LRRC61Q9BV99 259 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 PPIL1Q9Y3C6 166 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 U3KQA8 63 aa14.84□□□□□ -0.03
RPL28-208ENST00000559463 UNC13CQ8NB66 2214 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 A0A0U1RQS6 177 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 FAM149AA5PLN7 773 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 KCNK1O00180 336 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 GCATO75600 419 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 C1SP09871 688 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ALPIP09923 528 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 MYF5P13349 255 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CTPS1P17812 591 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 DYNLT1P63172 113 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ACOX1Q15067 660 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ALG11Q2TAA5 492 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 KCTD16Q68DU8 428 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 TMTC1Q8IUR5 882 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 TMEM139Q8IV31 216 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 GALNT15Q8N3T1 639 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 FAM181AQ8N9Y4 354 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 LMX1AQ8TE12 382 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 SCRN2Q96FV2 425 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 APOLD1Q96LR9 279 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.83□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 NBEAQ8NFP9 2946 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 NEMP2A6NFY4 417 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 PRLP01236 227 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 JCHAINP01591 159 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CAPNS1P04632 268 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 MMP2P08253 660 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ALPPL2P10696 532 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CKMT1AP12532 417 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 KRT10P13645 584 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CES1P23141 567 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ETV3P41162 512 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 PPARDQ03181 441 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ADCY2Q08462 1091 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 AP1B1Q10567 949 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ILKQ13418 452 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 C1orf61Q13536 156 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 LLGL1Q15334 1064 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 DEFB133Q30KQ1 61 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 PRRT3Q5FWE3 981 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 DENND2CQ68D51 928 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ENPP7Q6UWV6 458 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 USP45Q70EL2 814 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 CNTD1Q8N815 330 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 KRT35Q92764 455 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 NUS1Q96E22 293 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 DTD2Q96FN9 168 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 PDXPQ96GD0 296 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 TBATAQ96M53 351 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 WDR92Q96MX6 357 aa14.82□□□□□ -0.04
RPL28-208ENST00000559463 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms