RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556787.5

PAPOLA-222, Transcript of poly(A) polymerase alpha, human

TSL 2

Gene PAPOLA, Length 806 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PAPOLA-222	ENST00000556787	CTF1	Q16619	201 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CDC73	Q6P1J9	531 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	LCTL	Q6UWM7	567 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZBTB2	Q8N680	514 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM68	Q96MH6	324 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAP1L4	Q99733	375 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC25A18	Q9H1K4	315 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ASAH2	Q9NR71	780 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	VDAC3	Q9Y277	283 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CNTNAP2	Q9UHC6	1331 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GTPBP1	O00178	669 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC16A5	O15375	505 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	UBL4A	P11441	157 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	KRT10	P13645	584 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ZNF12	P17014	697 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ITGB8	P26012	769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	NAE1	Q13564	534 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DHX34	Q14147	1143 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRICKLE4	Q2TBC4	344 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCNI2	Q6ZMN8	369 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PGBD5	Q8N414	524 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	NEK9	Q8TD19	979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	GTF3C6	Q969F1	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	BICD1	Q96G01	975 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLEKHA4	Q9H4M7	779 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787	PROCR	Q9UNN8	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PAPOLA-222	ENST00000556787		J3KR12	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CCNDBP1	O95273	360 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SPARC	P09486	303 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SHMT1	P34896	483 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	DDIT3	P35638	169 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	BNC1	Q01954	994 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	DLG1	Q12959	904 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TRAF3	Q13114	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	OLIG2	Q13516	323 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	MMEL1	Q495T6	779 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SFR1	Q86XK3	245 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	WDR63	Q8IWG1	891 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PCYOX1L	Q8NBM8	494 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	RFFL	Q8WZ73	363 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	C3orf30	Q96M34	536 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	DLGAP2	Q9P1A6	1054 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	STON1	Q9Y6Q2	735 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CPED1	A4D0V7	1026 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TNFSF14	O43557	240 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	ITGAX	P20702	1163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SSTR2	P30874	369 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	POU5F1B	Q06416	359 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SGO1	Q5FBB7	561 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	TSSK4	Q6SA08	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	PRSS57	Q6UWY2	283 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	RBM23	Q86U06	439 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	NOXA1	Q86UR1	476 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PAPOLA-222	ENST00000556787	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62

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