RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548823.1

CTDSP2-204, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 1,368 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-204ENST00000548823 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 TRHDEQ9UKU6 1024 aa20.18■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 NPC1O15118 1278 aa20.17■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 FBXO36Q8NEA4 188 aa20.17■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 ACSS3Q9H6R3 686 aa20.17■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 IGLV3-27P01718 113 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 APRTP07741 180 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 ATP1A2P50993 1020 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 TPGS1Q6ZTW0 290 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 TADA2BQ86TJ2 420 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 PALM2Q8IXS6 379 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 FAM181AQ8N9Y4 354 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 CCNYQ8ND76 341 aa20.16■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 SNX19Q92543 992 aa20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 SLCO1A2P46721 670 aa20.15■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF567Q8N184 647 aa20.15■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 NACA2Q9H009 215 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 TM9SF3Q9HD45 589 aa20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
CTDSP2-204ENST00000548823 SNX10Q9Y5X0 201 aa20.15■□□□□ 0.82
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CTDSP2-204ENST00000548823 PTPN3P26045 913 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDSP2-204ENST00000548823 ELK3P41970 407 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDSP2-204ENST00000548823 LEKR1Q6ZMV7 388 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF534Q76KX8 674 aa20.14■□□□□ 0.81
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CTDSP2-204ENST00000548823 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
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CTDSP2-204ENST00000548823 WISP1O95388 367 aa20.13■□□□□ 0.81
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CTDSP2-204ENST00000548823 HES3Q5TGS1 186 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 LRRC8BQ6P9F7 803 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 KLHDC10Q6PID8 442 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 CYS1Q717R9 158 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 CCNJLQ8IV13 435 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa20.13■□□□□ 0.81
CTDSP2-204ENST00000548823 ZNF683Q8IZ20 524 aa20.13■□□□□ 0.81
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