RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524131.5

MEG3-223, Transcript of maternally expressed 3, human

TSL 5 BASIC

Gene MEG3, Length 721 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEG3-223	ENST00000524131	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TTC17	Q96AE7	1141 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CELF6	Q96J87	481 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	WDR83	Q9BRX9	315 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GLOD4	Q9HC38	313 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BFAR	Q9NZS9	450 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		11.77	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MYLK	Q15746	1914 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SMIM23	A6NLE4	172 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NEBL	O76041	1014 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IRF1	P10914	325 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NFKB1	P19838	968 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SSTR1	P30872	391 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MSH2	P43246	934 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLCO1A2	P46721	670 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SERPINB9	P50453	376 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PAPOLA	P51003	745 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GYS2	P54840	703 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MPP3	Q13368	585 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NADSYN1	Q6IA69	706 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	C19orf48	Q6RUI8	117 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GLRX5	Q86SX6	157 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SETD3	Q86TU7	594 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PDZD3	Q86UT5	571 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BBS5	Q8N3I7	341 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLC44A1	Q8WWI5	657 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IGSF8	Q969P0	613 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IL22	Q9GZX6	179 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SP110	Q9HB58	689 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MPP6	Q9NZW5	540 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MARK1	Q9P0L2	795 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SAMD15	Q9P1V8	674 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SUSD2	Q9UGT4	822 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ATM	Q13315	3056 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	KNL1	Q8NG31	2342 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CXorf51A	A0A1B0GTR3	108 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131		A0A1B0GVM2	712 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	ILVBL	A1L0T0	632 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TYW5	A2RUC4	315 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	FAM159B	A6NKW6	160 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	PRAMEF11	O60813	436 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	POLB	P06746	335 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HMBS	P08397	361 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	INHBA	P08476	426 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TYR	P14679	529 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CES1	P23141	567 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GCA	P28676	217 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	OR1E1	P30953	314 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	IRAK1	P51617	712 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	GNGT1	P63211	74 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CDH17	Q12864	832 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	DNAJC3	Q13217	504 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SERINC3	Q13530	473 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	COL28A1	Q2UY09	1125 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MARC1	Q5VT66	337 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	HTR3D	Q70Z44	454 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	TRABD2A	Q86V40	505 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CHPF	Q8IZ52	775 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	MDM1	Q8TC05	714 aa		11.75	□□□□□ -0.53
MEG3-223	ENST00000524131	CDKL2	Q92772	493 aa		11.75	□□□□□ -0.53

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