RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515965.1

RNU6-377P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 377, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-377P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-377P-201ENST00000515965 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MKLN1Q9UL63 735 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 STON1Q9Y6Q2 735 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 EVPLQ92817 2033 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 A0A0U1RQJ8 604 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 DYTNA2CJ06 578 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TMEM202A6NGA9 273 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TIMM23O14925 209 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 INSIG1O15503 277 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBED4O75132 1171 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FTCDO95954 541 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ALPLP05186 524 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 DDX5P17844 614 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MAOAP21397 527 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CASP2P42575 452 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNJ4P48050 445 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 BNC1Q01954 994 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TRAF2Q12933 501 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 NAE1Q13564 534 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 EFNB3Q15768 340 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 COL28A1Q2UY09 1125 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SLC45A4Q5BKX6 768 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 C6orf141Q5SZD1 244 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM69BQ5VUD6 431 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TSSK4Q6SA08 328 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 KLHL24Q6TFL4 600 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LCTLQ6UWM7 567 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 QSOX2Q6ZRP7 698 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SHFQ7M4L6 423 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZBTB2Q8N680 514 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IQCF1Q8N6M8 205 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FAM216AQ8WUB2 273 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SGCDQ92629 289 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMARCE1Q969G3 411 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PHF21BQ96EK2 531 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 WDFY2Q96P53 400 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SH3GL2Q99962 352 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDZD7Q9H5P4 517 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LTB4R2Q9NPC1 389 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRMD3A2A2Y4 597 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SCAMP1O15126 338 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 KCNAB3O43448 404 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZIC3O60481 467 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 DOK2O60496 412 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 OR2C1O95371 312 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MLYCDO95822 493 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ACADMP11310 421 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 RARGP13631 454 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZNF12P17014 697 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LMO1P25800 156 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 NFKBIAP25963 317 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 CDC25AP30304 524 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 TM4SF1P30408 202 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ARL3P36405 182 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 RPL3P39023 403 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 UBA7P41226 1012 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PCYT1AP49585 367 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SORDQ00796 357 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 EGR4Q05215 589 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 MED22Q15528 200 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 LRCH2Q5VUJ6 765 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 PDXDC1Q6P996 788 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 IKBIPQ70UQ0 350 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 SPATA6LQ8N4H0 392 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-377P-201ENST00000515965 FRMD1Q8N878 549 aa2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms