RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 KLHL32Q96NJ5 620 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 LRRC27Q9C0I9 530 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZHX3Q9H4I2 956 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FAM204AQ9H8W3 233 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GPR35Q9HC97 309 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DKK2Q9UBU2 259 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 L1RE1Q9UN81 338 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SLC8A2Q9UPR5 921 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CCL26Q9Y258 94 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TCHHQ07283 1943 aa7.17□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MYMKA6NI61 221 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TISP43B9A030 160 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FAM227AF5H4B4 570 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EXTL3O43909 919 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 NDUFA10O95299 355 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 NFATC1O95644 943 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 APBB3O95704 486 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GPANK1O95872 356 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CHEK2O96017 543 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ELANEP08246 267 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FAM163BP0C2L3 166 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RBP5P82980 135 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SHC2P98077 582 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CUL4AQ13619 759 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GBX1Q14549 363 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 LPAL2Q16609 132 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SPDYE7PQ495Y7 208 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TIGD2Q4W5G0 525 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EMC10Q5UCC4 262 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RRAGBQ5VZM2 374 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TXNDC8Q6A555 127 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 IL31Q6EBC2 164 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FAM171BQ6P995 826 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRF2Q8IZF7 708 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 MAB21L3Q8N8X9 362 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TMIEQ8NEW7 156 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EPSTI1Q96J88 318 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 C8orf48Q96LL4 319 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 P2RY13Q9BPV8 354 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ZSWIM1Q9BR11 485 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FAM213AQ9BRX8 229 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TTLL2Q9BWV7 592 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CUEDC2Q9H467 287 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EBF3Q9H4W6 596 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ECT2Q9H8V3 914 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA1586Q9HCI6 787 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SLAMF7Q9NQ25 335 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 VPS45Q9NRW7 570 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GKN1Q9NS71 199 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 C2orf42Q9NWW7 574 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CDH9Q9ULB4 789 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 UBE4BO95155 1302 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 HELZP42694 1942 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 RHOBTB1O94844 696 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GCNT3O95395 438 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 OLFM2O95897 454 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM191BP0C7N4 346 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC192P0DO97 292 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 TACR2P21452 398 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 IFNAR2P48551 515 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 HSD11B2P80365 405 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 KCNB1Q14721 858 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 ELF2Q15723 593 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 PLK5Q496M5 336 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 NPNTQ6UXI9 565 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 USP49Q70CQ1 688 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 WDR49Q8IV35 697 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SYCP3Q8IZU3 236 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 GPD1LQ8N335 351 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 CD101Q93033 1021 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 SAAL1Q96ER3 474 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4D-222ENST00000514552 BOD1Q96IK1 185 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms