RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514384.1

SMIM20-202, Transcript of small integral membrane protein 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SMIM20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20-202ENST00000514384 RILPQ96NA2 401 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SORT1Q99523 831 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 SERPINI1Q99574 410 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TTC1Q99614 292 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 CALN1Q9BXU9 219 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 FAM117AQ9C073 453 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ELOVL4Q9GZR5 314 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 EBF3Q9H4W6 596 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 STK39Q9UEW8 545 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 POMPQ9Y244 141 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SMIM20-202ENST00000514384 F5P12259 2224 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 A0A0A0MRY4 1105 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TEX51A0A1B0GUA7 166 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA8OA6NCC3 632 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GOLGA8NF8WBI6 632 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 OPHN1O60890 802 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TMCC1O94876 653 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 BAG2O95816 211 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ASLP04424 464 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PRKCGP05129 697 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MPOP05164 745 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SMIM18P0DKX4 95 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 THRAP10827 490 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MCF2P10911 925 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 HARSP12081 509 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MYF5P13349 255 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PDGFRAP16234 1089 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GLDCP23378 1020 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RBL1P28749 1068 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GP5P40197 560 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TNFSF9P41273 254 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SOX9P48436 509 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PSMD8P48556 350 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RPL34P49207 117 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SLC26A2P50443 739 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PCLAFQ15004 111 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MMEL1Q495T6 779 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CCDC14Q49A88 953 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SPANXN3Q5MJ09 141 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GRTP1Q5TC63 336 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ARMC3Q5W041 872 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TANGO2Q6ICL3 276 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 C16orf89Q6UX73 402 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MAVSQ7Z434 540 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 TMEM110Q86TL2 294 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PQLC1Q8N2U9 271 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 EMC1Q8N766 993 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 GSTCDQ8NEC7 633 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ITFG2Q969R8 447 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CLPTM1LQ96KA5 538 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SPATA13Q96N96 652 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PCYT2Q99447 389 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CPNE1Q99829 537 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 EBF4Q9BQW3 602 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MECRQ9BV79 373 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 BRD9Q9H8M2 597 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 COPG2Q9UBF2 871 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 DKK4Q9UBT3 224 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 PCSK1NQ9UHG2 260 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SIX4Q9UIU6 781 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RAD54BQ9Y620 910 aa7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 COL6A6A6NMZ7 2263 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 SPAG17Q6Q759 2223 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGAP10A1A4S6 786 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 RGSL1A5PLK6 1076 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 FAM149AA5PLN7 773 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 KPNA7A9QM74 516 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 M0QYV0 167 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 MEN1O00255 615 aa7.26□□□□□ -1.25
SMIM20-202ENST00000514384 CYB561D2O14569 222 aa7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms