RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC14Q15048 493 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CDKN3Q16667 212 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CRTC1Q6UUV9 634 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RFLNAQ6ZTI6 216 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PELI3Q8N2H9 469 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 UBL4BQ8N7F7 174 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PLA2G15Q8NCC3 412 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SPATA22Q8NHS9 363 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP15.24■□□□□ 0.034e-7■■■□□ 18.8
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM118BQ9BPY3 351 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A51Q9H1U9 297 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PCDH9Q9HC56 1237 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LZTFL1Q9NQ48 299 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 KLF15Q9UIH9 416 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TMEM131Q92545 1883 aa15.24■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A0J9YYE9 177 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TRBC1P01850 177 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ELFN1P0C7U0 828 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RBL1P28749 1068 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PTSQ03393 145 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 INPP5AQ14642 412 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 QPCTQ16769 361 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 MEI1Q5TIA1 1274 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF567Q8N184 647 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC25A45Q8N413 288 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PAF1Q8N7H5 531 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PDLIM2Q96JY6 352 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNF1Q9H3M0 494 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 USP29Q9HBJ7 922 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PCNX2A6NKB5 2137 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SPEGQ15772 3267 aa15.23■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 FLRT2O43155 660 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 MTSS1O43312 755 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TJP3O95049 919 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL26P61254 145 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC14A2Q15849 920 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF542PQ5EBM4 170 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 Q6ZVL8 140 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 USP45Q70EL2 814 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 OXR1Q8N573 874 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 IFT43Q96FT9 208 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LYSMD1Q96S90 227 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC32A1Q9H598 525 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 UCKL1Q9NWZ5 548 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.22■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 NCOR2Q9Y618 2525 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ANKRD66B4E2M5 251 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 H7C0C1 242 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 K7ESM1 405 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 SDC3O75056 442 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 GIMD1P0DJR0 217 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RBP3P10745 1247 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 NFKB1P19838 968 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 DGKAP23743 735 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 TRIM23P36406 574 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ETV3P41162 512 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CETN2P41208 172 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP5OP48047 213 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 YPEL5P62699 121 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 ACOX1Q15067 660 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 CCDC181Q5TID7 509 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 LRRC66Q68CR7 880 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 KCTD16Q68DU8 428 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 KDELC1Q6UW63 502 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 PID1Q7Z2X4 250 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 KDELC2Q7Z4H8 507 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 EID2BQ96D98 161 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 DTD2Q96FN9 168 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 FCRL5Q96RD9 977 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 VAT1Q99536 393 aa15.21■□□□□ 0.03
SH3BP2-225ENST00000513069 GORASP1Q9BQQ3 440 aa15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms