RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 UBXN10Q96LJ8 280 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RILPQ96NA2 401 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 C17orf80Q9BSJ5 609 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 FEM1AQ9BSK4 669 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC106Q9BWC9 280 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DRC3Q9H069 523 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CERS4Q9HA82 394 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 NLE1Q9NVX2 485 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 VWA7Q9Y334 891 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 OR51B4Q9Y5P0 310 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC162PA2VCL2 907 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SNAP91O60641 907 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LRG1P02750 347 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PIRTP0C851 137 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MYL4P12829 197 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 BMPR1AP36894 532 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SLC26A3P40879 764 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 IDH3AP50213 366 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CYP4F8P98187 520 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ASPHQ12797 758 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RCN2Q14257 317 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 FAM83EQ2M2I3 478 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TECRLQ5HYJ1 363 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MRNIPQ6NTE8 343 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC149Q6ZUS6 474 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TREML1Q86YW5 311 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CPXM2Q8N436 756 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 KLHL23Q8NBE8 558 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MDGA1Q8NFP4 955 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 OR4L1Q8NH43 312 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RMDN1Q96DB5 314 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ALG14Q96F25 216 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LRCH3Q96II8 777 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CDH19Q9H159 772 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 GPAMQ9HCL2 828 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ARMCX1Q9P291 453 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SPO11Q9Y5K1 396 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RAI2Q9Y5P3 530 aa8.22□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 BUD23O43709 281 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DLX3O60479 287 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ADH1AP07327 375 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PDHA1P08559 390 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CA8P35219 290 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 GRIA4P48058 902 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HK2P52789 917 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CDH18Q13634 790 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CSHL1Q14406 222 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PTPRCAPQ14761 206 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 TYSND1Q2T9J0 566 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RALGPS1Q5JS13 557 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 AGAP9Q5VTM2 703 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 NCEH1Q6PIU2 408 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LINGO4Q6UY18 593 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HTR3DQ70Z44 454 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RNF135Q8IUD6 432 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 HS6ST3Q8IZP7 471 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PNPLA1Q8N8W4 532 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 MAB21L3Q8N8X9 362 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 WFDC5Q8TCV5 224 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF576Q9H609 170 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 CATSPERZQ9NTU4 200 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 LHX3Q9UBR4 397 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 VPS51Q9UID3 782 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 VPS28Q9UK41 221 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF510Q9Y2H8 683 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 RAP2CQ9Y3L5 183 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 IRAK3Q9Y616 596 aa8.21□□□□□ -1.09
PDE4D-208ENST00000502484 ANKRD66B4E2M5 251 aa8.21□□□□□ -1.1
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL14O95715 111 aa8.21□□□□□ -1.1
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