RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	PKP1	Q13835	747 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	POU4F3	Q15319	338 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	MEA1	Q16626	185 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF658	Q5TYW1	1059 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	MACC1	Q6ZN28	852 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFAND4	Q86XD8	727 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GKN2	Q86XP6	184 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HID1	Q8IV36	788 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PASD1	Q8IV76	773 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KY	Q8NBH2	561 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	OR6K2	Q8NGY2	324 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF606	Q8WXB4	792 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB7B	Q96AH8	199 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TBATA	Q96M53	351 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KLF6	Q99612	283 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CMKLR1	Q99788	373 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CEP44	Q9C0F1	390 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRN3	Q9H3W5	708 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ASNSD1	Q9NWL6	643 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GEMIN8	Q9NWZ8	242 aa	Known RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	MPP6	Q9NZW5	540 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HECA	Q9UBI9	543 aa	Predicted RBP	10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR34	Q9UPC5	381 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		10.97	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KRIT1	O00522	736 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMA7	O14818	248 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GSC2	O15499	205 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SRGAP2	O75044	1071 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TM7SF2	O76062	418 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SMC2	O95347	1197 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	HTR1B	P28222	390 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CCKBR	P32239	447 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	SULT1E1	P49888	294 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	POLD3	Q15054	466 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF805	Q5CZA5	627 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	PHF19	Q5T6S3	580 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CXorf40A	Q8TE69	158 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	JPH3	Q8WXH2	748 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB12	Q8WXK4	309 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	USP7	Q93009	1102 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM159	Q96B96	161 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	CLPB	Q9H078	707 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		10.96	□□□□□ -0.65
SKAP2-209	ENST00000497511	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		10.96	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQM1	296 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	ILVBL	A1L0T0	632 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	PMM2	O15305	246 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	DAB1	O75553	588 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGRP1	O95267	797 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT2B4	P06133	528 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	XPA	P23025	273 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	GK	P32189	559 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	IGFALS	P35858	605 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	DEUP1	Q05D60	604 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	MORC3	Q14149	939 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	CLCA4	Q14CN2	919 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	C5orf22	Q49AR2	442 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	BORA	Q6PGQ7	559 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	ENPP7	Q6UWV6	458 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC7B	Q86TV6	843 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	DRC7	Q8IY82	874 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	SMARCE1	Q969G3	411 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	TSACC	Q96A04	125 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	CPXM1	Q96SM3	734 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	ACP6	Q9NPH0	428 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	PIGV	Q9NUD9	493 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	RRN3	Q9NYV6	651 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	STOML1	Q9UBI4	398 aa		10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	10.95	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQ27	194 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQ64	194 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PQC6	194 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	TOR1B	O14657	336 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	F9	P00740	461 aa		10.94	□□□□□ -0.66
SKAP2-209	ENST00000497511	CD82	P27701	267 aa		10.94	□□□□□ -0.66

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