RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 SUPT3HB4E1H0 165 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 SDHDO14521 159 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ACOT8O14734 319 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TPSB2P20231 275 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TPSAB1Q15661 275 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 DGUOKQ16854 277 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 FAM160B1Q5W0V3 765 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TRNP1Q6NT89 227 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 MCFD2Q8NI22 146 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 FAM162AQ96A26 154 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CDHR1Q96JP9 859 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 MORF4L1Q9UBU8 362 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TEKT2Q9UIF3 430 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 USP22Q9UPT9 525 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CPQQ9Y646 472 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PCNTO95613 3336 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PSME4Q14997 1843 aa12□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 GSRP00390 522 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 IFI30P13284 250 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 IDUAP35475 653 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 HADHAP40939 763 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 LIPEQ05469 1076 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 SPCS2Q15005 226 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RBBP7Q16576 425 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF534Q76KX8 674 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 LGI2Q8N0V4 545 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TERB1Q8NA31 727 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ITFG1Q8TB96 612 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 IL12RB2Q99665 862 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CENPOQ9BU64 300 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 BEX2Q9BXY8 128 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 DDIT4Q9NX09 232 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 COQ3Q9NZJ6 369 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 VWA5AO00534 786 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF195O14628 629 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 GCATO75600 419 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 FMO3P31513 532 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CCNA1P78396 465 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 STRIP1Q5VSL9 837 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CERKQ8TCT0 537 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD60Q9BZ19 345 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 GDAP2Q9NXN4 497 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 HACD3Q9P035 362 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ARPC2O15144 300 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 INMTO95050 263 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 LYPLA2O95372 231 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 VTNP04004 478 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ERCC2P18074 760 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ITGB6P18564 788 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 IL4RP24394 825 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PTPN9P43378 593 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 EFNA5P52803 228 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 C1QTNF8P60827 252 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RAB10P61026 200 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 VAC14Q08AM6 782 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ADIGQ0VDE8 80 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RAP1GAP2Q684P5 730 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 PPP4R4Q6NUP7 873 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 EFCAB12Q6NXP0 572 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TIFABQ6ZNK6 161 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CATSPER4Q7RTX7 472 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 UBASH3BQ8TF42 649 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RAB2BQ8WUD1 216 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 FAR1Q8WVX9 515 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 CLEC4DQ8WXI8 215 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 KCNA7Q96RP8 456 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF670Q9BS34 389 aa11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 MGEA5O60502 916 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 AHSGP02765 367 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 UGP2Q16851 508 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 NOMO2Q5JPE7 1267 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 MPZL3Q6UWV2 235 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 VSIG10LQ86VR7 867 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 RDH11Q8TC12 318 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa11.98□□□□□ -0.49
PRRX1-207ENST00000497230 ABCG8Q9H221 673 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.9 ms