RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486964.5

POLR1A-208, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 5

Gene POLR1A, Length 1,427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-208ENST00000486964 WDR70Q9NW82 654 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SEPT10Q9P0V9 454 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 DPP7Q9UHL4 492 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 WASF2Q9Y6W5 498 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 CDH23Q9H251 3354 aa9.66□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 A0A088AWK7 358 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 A0A0D9SEW6 157 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 A0A1B0GVM2 712 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 E2F8A0AVK6 867 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 TCAF2A6NFQ2 919 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 EPOPA6NHQ4 379 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 LEFTY2O00292 366 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 PER2O15055 1255 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 UGT1A9O60656 530 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ZMPSTE24O75844 475 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 HSPA4LO95757 839 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 BAG2O95816 211 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 HLA-DQB2P05538 268 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 CPA3P15088 417 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 GJA1P17302 382 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 TYK2P29597 1187 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 HSPA13P48723 471 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 LIMK2P53671 638 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SLC10A7Q0GE19 358 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 MED21Q13503 144 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 RAB30Q15771 203 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ANO4Q32M45 955 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SYCP2LQ5T4T6 812 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ARMC3Q5W041 872 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 KDELC1Q6UW63 502 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 RANBP10Q6VN20 620 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 PDSS2Q86YH6 399 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 CMTM8Q8IZV2 173 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 MPP5Q8N3R9 675 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 PGBD5Q8N414 524 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 KIAA1958Q8N8K9 716 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 VN1R2Q8NFZ6 395 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ARRDC2Q8TBH0 407 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 UCMAQ8WVF2 138 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 LMLNQ96KR4 655 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 CDH19Q9H159 772 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 SLC25A51Q9H1U9 297 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 UGT1A7Q9HAW7 530 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 UGT1A10Q9HAW8 530 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 UGT1A8Q9HAW9 530 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ARNT2Q9HBZ2 717 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ZMYM5Q9UJ78 669 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 CDH22Q9UJ99 828 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 EMCNQ9ULC0 261 aa9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 ENO4A6NNW6 628 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 XYLBO75191 536 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 ANXA9O76027 345 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 USP1O94782 785 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 CD160O95971 181 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 MMP2P08253 660 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 THRAP10827 490 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 IRF1P10914 325 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 MGAT1P26572 445 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 POLD2P49005 469 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 NPY2RP49146 381 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 IDH3AP50213 366 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 KPNA2P52292 529 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 HERC3Q15034 1050 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 TEAD2Q15562 447 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 GPR158Q5T848 1215 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 MARC1Q5VT66 337 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 Q7L0L9 218 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 KBTBD2Q8IY47 623 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 RIN3Q8TB24 985 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 DLG3Q92796 817 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 CNDP1Q96KN2 507 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 TTC1Q99614 292 aa9.65□□□□□ -0.87
POLR1A-208ENST00000486964 RBBP8Q99708 897 aa9.65□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms