RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 STK40Q8N2I9 435 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 DCLK2Q8N568 766 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 USP33Q8TEY7 942 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 FGF13Q92913 245 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 EID2BQ96D98 161 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CDKN2AIPNLQ96HQ2 116 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF778Q96MU6 729 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 HDAC8Q9BY41 377 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 VPS28Q9UK41 221 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 G3V2L1 256 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SPINT1O43278 529 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL2O95198 593 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CD151P48509 253 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 PFKPQ01813 784 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 HTR4Q13639 388 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 NEPROQ6NW34 567 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 KIRREL3Q8IZU9 778 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 PPM1NQ8N819 430 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TCP10LQ8TDR4 215 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 GDPD5Q8WTR4 605 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ASB12Q8WXK4 309 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CCT8L2Q96SF2 557 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 OMDQ99983 421 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 EPHX3Q9H6B9 360 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 KLHL14Q9P2G3 628 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 HCN2Q9UL51 889 aa6.46□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TPP1O14773 563 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TBX10O75333 385 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ERVK-10P10266 1014 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 GM2AP17900 193 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SLCO1A2P46721 670 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 RAB10P61026 200 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CACNG1Q06432 222 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 RALGDSQ12967 914 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 PCLAFQ15004 111 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 GALNTL6Q49A17 601 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ZYG11AQ6WRX3 759 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 MACC1Q6ZN28 852 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TPRG1Q6ZUI0 275 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 NEK10Q6ZWH5 1172 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 STRA8Q7Z7C7 330 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ZSWIM9Q86XI8 627 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 CPA6Q8N4T0 437 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 DNAAF3Q8N9W5 541 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ULK4Q96C45 1275 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 L3HYPDHQ96EM0 354 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 IFT43Q96FT9 208 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 RIPOR3Q96MK2 946 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 BIRC8Q96P09 236 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ECT2Q9H8V3 914 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 FBXO5Q9UKT4 447 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 C2orf81A6NN90 581 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SNX3O60493 162 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TSPAN3O60637 253 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 DLDP09622 509 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 PYGBP11216 843 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 SERPINA4P29622 427 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ARSDP51689 593 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 RHOAP61586 193 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 DPTQ07507 201 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 LY6G5CQ5SRR4 150 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 UNC5BQ8IZJ1 945 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 OR4L1Q8NH43 312 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 DDI1Q8WTU0 396 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 PTPRN2Q92932 1015 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 AGAP2Q99490 1192 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 GABRG3Q99928 467 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 IKBKGQ9Y6K9 419 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 NPHS1O60500 1241 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 GJB3O75712 270 aa6.45□□□□□ -1.38
PRKCI-202ENST00000476635 LAMP2P13473 410 aa6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms