RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 ZFYVE19Q96K21 471 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 OLFM1Q99784 485 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 OMDQ99983 421 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FANCEQ9HB96 536 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MTRRQ9UBK8 725 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SLCO1B7G3V0H7 640 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 GPX6P59796 221 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TUBA3CQ13748 450 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PTK2BQ14289 1009 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PARP15Q460N3 678 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 CEP78Q5JTW2 689 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 NXPE3Q969Y0 559 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TSGA13Q96PP4 275 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 DHRS4Q9BTZ2 278 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 GBA3Q9H227 469 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MBD2Q9UBB5 411 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SOX13Q9UN79 622 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 AK5Q9Y6K8 562 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GVM2 712 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TCAF2A6NFQ2 919 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ACSL4O60488 711 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MED26O95402 600 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 DNTTP04053 509 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SEMA3BQ13214 749 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ARMC12Q5T9G4 340 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 AAGABQ6PD74 315 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 HDDC2Q7Z4H3 204 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TRIM48Q8IWZ4 208 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PYROXD2Q8N2H3 581 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ACMSDQ8TDX5 336 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 S100ZQ8WXG8 99 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 APOPT1Q96IL0 206 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SPATA16Q9BXB7 569 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 NPC1O15118 1278 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TSPAN3O60637 253 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 WBP4O75554 376 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 CDH3P22223 829 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FGFR3P22607 806 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PRKCHP24723 683 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MAGEA8P43361 318 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MGAT5Q09328 741 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FAAP100Q0VG06 881 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 CBX3Q13185 183 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 C4orf33Q8N1A6 199 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SLC39A11Q8N1S5 342 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 BPIFB1Q8TDL5 484 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 HEXDCQ8WVB3 486 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 FAR2Q96K12 515 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PAAF1Q9BRP4 392 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 C8orf33Q9H7E9 229 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 CD207Q9UJ71 328 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ERVW-1Q9UQF0 538 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 DMTF1Q9Y222 760 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TMEM265A0A087WTH1 108 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 F5H423 210 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TBL1XO60907 577 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 LATS1O95835 1130 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PRNPP04156 253 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 RHOQP17081 205 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 RAB6CQ53S08 254 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ATAD3BQ5T9A4 648 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 ADAM32Q8TC27 787 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SH3KBP1Q96B97 665 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 LGMNQ99538 433 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 RAB6CQ9H0N0 254 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TMEM245Q9H330 911 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 GMIPQ9P107 970 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 STARD13Q9Y3M8 1113 aa7.69□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa7.68□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.68□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 EVPLLA8MZ36 301 aa7.68□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 GOLGA8RI6L899 631 aa7.68□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 PER2O15055 1255 aa7.68□□□□□ -1.18
USP54-210ENST00000466048 DDHD2O94830 711 aa7.68□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms