RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465848.1

DEGS1-204, Transcript of delta 4-desaturase, sphingolipid 1, humanhuman

TSL 2

Gene DEGS1, Length 633 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEGS1-204ENST00000465848 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ABHD11Q8NFV4 315 aa3.6□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 CAVIN3Q969G5 261 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 HDAC11Q96DB2 347 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TMEM237Q96Q45 408 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 FERMT1Q9BQL6 677 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 MGME1Q9BQP7 344 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SLC25A23Q9BV35 468 aa3.6□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 IFT27Q9BW83 186 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 THAP9Q9H5L6 903 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 AKIP1Q9NQ31 210 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 KLC4Q9NSK0 619 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 EPS15L1Q9UBC2 864 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa3.6□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 CMAHPQ9Y471 501 aa3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 MARCH11A6NNE9 402 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 VWC2LB2RUY7 222 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ZBTB14O43829 449 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 RFPL3SP0C7P2 107 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 GAP43P17677 238 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 ITGAXP20702 1163 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TGM2P21980 687 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 CYP2C18P33260 490 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 PLA2G5P39877 138 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 RCN2Q14257 317 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 SYT17Q9BSW7 474 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 TUBB2BQ9BVA1 445 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa3.59□□□□□ -1.83
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DEGS1-204ENST00000465848 MID1IP1Q9NPA3 183 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 NRIP3Q9NQ35 241 aa3.59□□□□□ -1.83
DEGS1-204ENST00000465848 SYBUQ9NX95 663 aa3.59□□□□□ -1.83
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