RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461219.5

SCAF8-204, Transcript of SR-related CTD associated factor 8, humanhuman

TSL 5

Gene SCAF8, Length 677 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF8-204ENST00000461219 ENC1O14682 589 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 MTSS1O43312 755 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 DGKAP23743 735 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 DAB2P98082 770 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ZBTB17Q13105 803 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 MTM1Q13496 603 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PPP2R5EQ16537 467 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ALG1LQ6GMV1 187 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KDM7AQ6ZMT4 941 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 MACC1Q6ZN28 852 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SPOCK2Q92563 424 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SCRN2Q96FV2 425 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 IL12RB2Q99665 862 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 APOOQ9BUR5 198 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ADGRE3Q9BY15 652 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 EVA1BQ9NVM1 165 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 DNPEPQ9ULA0 475 aa20.55■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 H7C0C1 242 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ARHGAP6O43182 974 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KRT86O43790 486 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PIAS2O75928 621 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CSF2P04141 144 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PDHA1P08559 390 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ALPIP09923 528 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ATP5OP48047 213 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PEX5P50542 639 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 BLKP51451 505 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PPARDQ03181 441 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NIPAL4Q0D2K0 466 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 AGERQ15109 404 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CNGA3Q16281 694 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 TAZQ16635 292 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ENPP7Q6UWV6 458 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SPASTQ9UBP0 616 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 TRIM10Q9UDY6 481 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 DOLKQ9UPQ8 538 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 OR1A2Q9Y585 309 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NCOR2Q9Y618 2525 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PTPRBP23467 1997 aa20.54■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PSMD11O00231 422 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CTSEP14091 401 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NME1P15531 152 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KELP23276 732 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 RPL26P61254 145 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 NFATC4Q14934 902 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PCSK7Q16549 785 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 HID1Q8IV36 788 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PHACTR4Q8IZ21 702 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ARRDC2Q8TBH0 407 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 LMX1AQ8TE12 382 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PIH1D2Q8WWB5 315 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.53■□□□□ 0.883e-10■■■■■ 33.6
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SCAF8-204ENST00000461219 UCKL1Q9NWZ5 548 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KLQ9UEF7 1012 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 MOSPD1Q9UJG1 213 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 GUCA1BQ9UMX6 200 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 LRP4O75096 1905 aa20.53■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 A0A0J9YYE9 177 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 HACD1B0YJ81 288 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 AQP9O43315 295 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 TJP3O95049 919 aa20.52■□□□□ 0.88
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SCAF8-204ENST00000461219 TRBC1P01850 177 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 APOC2P02655 101 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 HNF1BP35680 557 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
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SCAF8-204ENST00000461219 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 LRRC66Q68CR7 880 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 BBS12Q6ZW61 710 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 KDELC2Q7Z4H8 507 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 WDR92Q96MX6 357 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 DUSP23Q9BVJ7 150 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SCNM1Q9BWG6 230 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 WDR26Q9H7D7 661 aa20.52■□□□□ 0.88
SCAF8-204ENST00000461219 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa20.51■□□□□ 0.87
SCAF8-204ENST00000461219 CAPN8A6NHC0 703 aa20.51■□□□□ 0.87
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