RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 GDF3Q9NR23 364 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 IMPACTQ9P2X3 320 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 LCMT1Q9UIC8 334 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RAI2Q9Y5P3 530 aa7.04□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 A6NNZ2 444 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 F5H423 210 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 SOCS5O75159 536 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 C1SP09871 688 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCZ1BP86790 482 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PTSQ03393 145 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ELP6Q0PNE2 266 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 AP1B1Q10567 949 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 WASHC5Q12768 1159 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 OVGP1Q12889 678 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf61Q13536 156 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 INPP5AQ14642 412 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 GRM3Q14832 879 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 AGERQ15109 404 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TCEA2Q15560 299 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CRTC1Q6UUV9 634 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 GLRX5Q86SX6 157 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DAAM2Q86T65 1068 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 VSIG1Q86XK7 387 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 LRRC49Q8IUZ0 686 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SFTPA2Q8IWL1 248 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 KATNAL2Q8IYT4 538 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 DENND6BQ8NEG7 585 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA22Q8NHS9 363 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 FATE1Q969F0 183 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 EID2BQ96D98 161 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 COQ10AQ96MF6 247 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 AGAP3Q96P47 875 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 APOOQ9BUR5 198 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CLPBQ9H078 707 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC32A1Q9H598 525 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 UBP1Q9NZI7 540 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK13Q9UKR3 277 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 PHTF1Q9UMS5 762 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1A2Q9Y585 309 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.03□□□□□ -1.28
RABGEF1-206ENST00000461017 U3KQA8 63 aa7.03□□□□□ -1.28
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RABGEF1-206ENST00000461017 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0J9YYE9 177 aa7.02□□□□□ -1.29
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RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM202A6NGA9 273 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ENC1O14682 589 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 FPGTO14772 594 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGLEC6O43699 453 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 DFNA5O60443 496 aa7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RABGEF1-206ENST00000461017 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP7.02□□□□□ -1.29
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