RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450865.2

VNN3-210, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene VNN3, Length 596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-210ENST00000450865 DR1Q01658 176 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 SATB1Q01826 763 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 DSC2Q02487 901 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 BCL2L1Q07817 233 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 WASHC5Q12768 1159 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ENPP2Q13822 863 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TUBB2AQ13885 445 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GRM3Q14832 879 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CST6Q15828 149 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CYP1B1Q16678 543 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TEX44Q53QW1 395 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 FAM182AQ5T1J6 154 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 C9orf64Q5T6V5 341 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 FAXCQ5TGI0 409 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 C8orf74Q6P047 294 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TTC27Q6P3X3 843 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CAPN12Q6ZSI9 719 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 SRLQ86TD4 932 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CTAGE6Q86UF2 777 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TMPRSS6Q8IU80 811 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PGBD5Q8N414 524 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TEX26Q8N6G2 289 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TMEM105Q8N8V8 129 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CHST14Q8NCH0 376 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 SPATA4Q8NEY3 305 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 IPMKQ8NFU5 416 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 OR2A12Q8NGT7 310 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 FRS2Q8WU20 508 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PTPRN2Q92932 1015 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TEKT5Q96M29 485 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 KRT12Q99456 494 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 IL12RB2Q99665 862 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 OMDQ99983 421 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TUBB2BQ9BVA1 445 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 SLC6A17Q9H1V8 727 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GBA3Q9H227 469 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 UBP1Q9NZI7 540 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PAK5Q9P286 719 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 RNF112Q9ULX5 631 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.88□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 A0A1W2PQF6 199 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 MID1O15344 667 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 SOCS5O75159 536 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PMPCBO75439 489 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ANXA9O76027 345 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CPP00450 1065 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 KRT14P02533 472 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ETS1P14921 441 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GLB1P16278 677 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GABRG2P18507 467 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CES1P23141 567 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 NFKBIAP25963 317 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PXNP49023 591 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 COPAP53621 1224 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 EPHB1P54762 984 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GEMP55040 296 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GPS1Q13098 491 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 FZD5Q13467 585 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 MYLK3Q32MK0 819 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 TMEM31Q5JXX7 168 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CCDC70Q6NSX1 233 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 PRUNE1Q86TP1 453 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CNTD1Q8N815 330 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CEP112Q8N8E3 955 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 ATL2Q8NHH9 583 aa6.87□□□□□ -1.31
VNN3-210ENST00000450865 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms