RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448828.5

NME4-206, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 2

Gene NME4, Length 1,167 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-206ENST00000448828 GULP1Q9UBP9 304 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 GPSM3Q9Y4H4 160 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 MYLKQ15746 1914 aa22.78■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 YY2O15391 372 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 ARSEP51690 589 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 GALNT2Q10471 571 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 ARHGEF7Q14155 803 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 CNGA3Q16281 694 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 NYAP1Q6ZVC0 841 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 USP45Q70EL2 814 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 SLC35F3Q8IY50 421 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 FAM71BQ8TC56 605 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 CHP1Q99653 195 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 SEMA3CQ99985 751 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 WDR26Q9H7D7 661 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 HAUS2Q9NVX0 235 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 PHTF1Q9UMS5 762 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 ZFHX4Q86UP3 3567 aa22.77■■□□□ 1.24
NME4-206ENST00000448828 LRRD1A4D1F6 860 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CSO75390 466 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TNFP01375 233 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CTPS1P17812 591 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 MAN1A1P33908 653 aa22.76■■□□□ 1.23
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NME4-206ENST00000448828 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 COL28A1Q2UY09 1125 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 GKN2Q86XP6 184 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CNGA4Q8IV77 575 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CCNYQ8ND76 341 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 OR56A4Q8NGH8 313 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 SLC35G2Q8TBE7 412 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 LRRN4Q8WUT4 740 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 BOCQ9BWV1 1114 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RAI2Q9Y5P3 530 aa22.76■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 PGLSO95336 258 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KELP23276 732 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 EPHB1P54762 984 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KIAA1024LP59773 190 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 ODF2Q5BJF6 829 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 NAT6Q93015 286 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 GPR34Q9UPC5 381 aa22.75■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TMEM202A6NGA9 273 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 BRINP1O60477 761 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KRT10P13645 584 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TNNT1P13805 278 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 GM2AP17900 193 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 MX2P20592 715 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TGM2P21980 687 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 ETV3P41162 512 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 DSC2Q02487 901 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 GBE1Q04446 702 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 PERM1Q5SV97 790 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KCTD16Q68DU8 428 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RHOT2Q8IXI1 618 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 NDUFAF2Q8N183 169 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TEX26Q8N6G2 289 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 ARL10Q8N8L6 244 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KYQ8NBH2 561 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 COQ10AQ96MF6 247 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 FGF22Q9HCT0 170 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP22.74■■□□□ 1.235e-8■□□□□ 8.7
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NME4-206ENST00000448828 LRP4O75096 1905 aa22.74■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 MATN3O15232 486 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 USP12O75317 370 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KRT1P04264 644 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 MPOP05164 745 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 LHCGRP22888 699 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 KDELR1P24390 212 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RTP5Q14D33 572 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 PTPRRQ15256 657 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CDCP2Q5VXM1 449 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RAET1GQ6H3X3 334 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 PNCKQ6P2M8 343 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TAF8Q7Z7C8 310 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 TSPAN33Q86UF1 283 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 PELI3Q8N2H9 469 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 RAPGEF5Q92565 580 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 LGR4Q9BXB1 951 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.73■■□□□ 1.23
NME4-206ENST00000448828 FREM2Q5SZK8 3169 aa22.72■■□□□ 1.23
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