RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448188.1

SNORD57-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 57, humanhuman

BASIC

Gene SNORD57, Length 72 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleolus, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD57-201ENST00000448188 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 HCAR2Q8TDS4 363 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 LRTOMTQ8WZ04 291 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SNX19Q92543 992 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 TIMD4Q96H15 378 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 SEC16BQ96JE7 1060 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 KLHL32Q96NJ5 620 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 PNKPQ96T60 521 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF670Q9BS34 389 aa-0.53□□□□□ -2.49
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SNORD57-201ENST00000448188 AGXT2Q9BYV1 514 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 DPH1Q9BZG8 443 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 NEUROG2Q9H2A3 272 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 C11orf49Q9H6J7 331 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 USP29Q9HBJ7 922 aa-0.53□□□□□ -2.49
SNORD57-201ENST00000448188 ZNF304Q9HCX3 659 aa-0.53□□□□□ -2.49
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SNORD57-201ENST00000448188 UBQLN2Q9UHD9 624 aa-0.53□□□□□ -2.49
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SNORD57-201ENST00000448188 TRHDEQ9UKU6 1024 aa-0.53□□□□□ -2.49
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SNORD57-201ENST00000448188 UBR2Q8IWV8 1755 aa-0.53□□□□□ -2.49
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SNORD57-201ENST00000448188 MYO9BQ13459 2157 aa-0.53□□□□□ -2.49
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SNORD57-201ENST00000448188 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa-0.54□□□□□ -2.5
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SNORD57-201ENST00000448188 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
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SNORD57-201ENST00000448188 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
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SNORD57-201ENST00000448188 SCG5P05408 212 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 LPLP06858 475 aa-0.54□□□□□ -2.5
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SNORD57-201ENST00000448188 ZNF17P17021 662 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 GARTP22102 1010 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 MCCP23508 829 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 ACVR2AP27037 513 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 HTR1EP28566 365 aa-0.54□□□□□ -2.5
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SNORD57-201ENST00000448188 MC2RQ01718 297 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 FMO1Q01740 532 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 SEMG2Q02383 582 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 KLRB1Q12918 225 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 MTA1Q13330 715 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 ARHGAP44Q17R89 818 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 CCDC144BQ3MJ40 725 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 EPC2Q52LR7 807 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 TM4SF20Q53R12 229 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 DACT2Q5SW24 774 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 CATSPEREQ5SY80 951 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 BEND3Q5T5X7 828 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 MEI1Q5TIA1 1274 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 SYDE2Q5VT97 1194 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 CST9Q5W186 159 aa-0.54□□□□□ -2.5
SNORD57-201ENST00000448188 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP-0.54□□□□□ -2.5
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