RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 RAD51BO15315 384 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 RASA4O43374 803 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 BUB1O43683 1085 aa11.77□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TM7SF2O76062 418 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 GSRP00390 522 aa11.77□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 H3BRJ5 948 aa11.76□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 OR6K2Q8NGY2 324 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 SEMA3CQ99985 751 aa11.76□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 LRRC61Q9BV99 259 aa11.76□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 KLF15Q9UIH9 416 aa11.76□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 D6RAR5 112 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 KRIT1O00522 736 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 SPINT1O43278 529 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ZSCAN12O43309 604 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 PPFIA2O75334 1257 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 ZMPSTE24O75844 475 aa11.75□□□□□ -0.53
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PRAME-210ENST00000442481 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 TTC7BQ86TV6 843 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CPNE8Q86YQ8 564 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 RBFAQ8N0V3 343 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 CENPTQ96BT3 561 aa11.75□□□□□ -0.53
PRAME-210ENST00000442481 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa11.75□□□□□ -0.53
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