RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 KRT10P13645 584 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 CCKBRP32239 447 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 AP1S1P61966 158 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 SKOR1P84550 965 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 IL10RBQ08334 325 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 CLN3Q13286 438 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 STX1AQ16623 288 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 XKR5Q6UX68 686 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 LIPIQ6XZB0 460 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 FAM117AQ9C073 453 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 WDR26Q9H7D7 661 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ZWILCHQ9H900 591 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PDFQ9HBH1 243 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 CYP4F12Q9HCS2 524 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PISDQ9UG56 409 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 SEPT3Q9UH03 358 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PCSK1NQ9UHG2 260 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 APPL1Q9UKG1 709 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 MYO6Q9UM54 1294 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 COL6A6A6NMZ7 2263 aa11.91□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 RHPN2P1A8MT19 583 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 A8MX80 341 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 B4DGG1 531 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 NVLO15381 856 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PRKCGP05129 697 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 LIPCP11150 499 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 SFTPCP11686 197 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ERCC2P18074 760 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ARL4AP40617 200 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.9□□□□□ -0.51e-9■■■■□ 21
DDX39B-210ENST00000431908 MAMLD1Q13495 774 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF235Q14590 738 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 LBRQ14739 615 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 MAP9Q49MG5 647 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 FILIP1LQ4L180 1135 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 C14orf28Q4W4Y0 310 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 MANEAQ5SRI9 462 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 CERCAMQ5T4B2 595 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PHF19Q5T6S3 580 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PNCKQ6P2M8 343 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PCSK4Q6UW60 755 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 RFX8Q6ZV50 586 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 DPPA4Q7L190 304 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PIM3Q86V86 326 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 GPR156Q8NFN8 814 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 TTC9Q92623 222 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 VOPP1Q96AW1 172 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PDXPQ96GD0 296 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ZNF599Q96NL3 588 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 GSDMCQ9BYG8 508 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 LOXL2Q9Y4K0 774 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 SCINQ9Y6U3 715 aa11.9□□□□□ -0.5
DDX39B-210ENST00000431908 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 A0A1W2PQM1 296 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 GOLGA6CA6NDK9 693 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 GOLGA6BA6NDN3 693 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM202A6NGA9 273 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 LRRC10BA6NIK2 292 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 GOLGA6DP0CG33 693 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 CD82P27701 267 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 HCAR3P49019 387 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 PDX1P52945 283 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 MAPK10P53779 464 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 AFMIDQ63HM1 303 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 DENND2CQ68D51 928 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 PLA2G15Q8NCC3 412 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 OR1E3Q8WZA6 343 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 NUS1Q96E22 293 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 SGF29Q96ES7 293 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 TRIM11Q96F44 468 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 TMEM168Q9H0V1 697 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.89□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 PRSS38A1L453 326 aa11.88□□□□□ -0.51
DDX39B-210ENST00000431908 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms