RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429504.6

CERS1-201, Transcript of ceramide synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CERS1, Length 2,094 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERS1-201ENST00000429504 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 NDST3O95803 873 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 SLC11A2P49281 568 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 CDH4P55283 916 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 GALNT3Q14435 633 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 GPR158Q5T848 1215 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 PELI3Q8N2H9 469 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 PDZD8Q8NEN9 1154 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 FBXO22Q8NEZ5 403 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 OVCA2Q8WZ82 227 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 STK39Q9UEW8 545 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 SCN5AQ14524 2016 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 PITPNM1O00562 1244 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 OGNP20774 298 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
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CERS1-201ENST00000429504 SLC8B1Q6J4K2 584 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 KLHDC10Q6PID8 442 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 ISCA2Q86U28 154 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 CUZD1Q86UP6 607 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 PSKH2Q96QS6 385 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 MEAF6Q9HAF1 191 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 POPDC3Q9HBV1 291 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 CRYL1Q9Y2S2 319 aa27.71■■■□□ 2.03
CERS1-201ENST00000429504 TBKBP1A7MCY6 615 aa27.7■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 GNRH1P01148 92 aa27.7■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PDHA1P08559 390 aa27.7■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 DSG1Q02413 1049 aa27.7■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 L3HYPDHQ96EM0 354 aa27.7■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CCDC162PA2VCL2 907 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 H3BNC9 293 aa27.69■■■□□ 2.02
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CERS1-201ENST00000429504 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
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CERS1-201ENST00000429504 SUOXP51687 545 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CHSY3Q70JA7 882 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PIM3Q86V86 326 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PGAM4Q8N0Y7 254 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 OR7D4Q8NG98 312 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 RCN3Q96D15 328 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ALG9Q9H6U8 611 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TUFMP49411 452 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 APLP1P51693 650 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PLK1P53350 603 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 IL31Q6EBC2 164 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ZNF549Q6P9A3 640 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 IZUMO2Q6UXV1 221 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 KBTBD6Q86V97 674 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PHF21BQ96EK2 531 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 NACA2Q9H009 215 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 GSTO2Q9H4Y5 243 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CATSPERZQ9NTU4 200 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 MTRRQ9UBK8 725 aa27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP27.69■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 A6NHS1 94 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 INHBCP55103 352 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TCTN1Q2MV58 587 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TYSND1Q2T9J0 566 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 SPNS2Q8IVW8 549 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 LRRC43Q8N309 656 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 OR52K2Q8NGK3 314 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 OR13C4Q8NGS5 318 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 OR4L1Q8NH43 312 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 MARK4Q96L34 752 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ECSITQ9BQ95 431 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TANC1Q9C0D5 1861 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 EFCAB1Q9HAE3 211 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TRPC7Q9HCX4 862 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 ADAM12O43184 909 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CLDN11O75508 207 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 STC1P52823 247 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 EFCAB3Q8N7B9 438 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 SLAIN1Q8ND83 568 aa27.68■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PLD4Q96BZ4 506 aa27.68■■■□□ 2.02
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CERS1-201ENST00000429504 ZNF840PA6NDX5 716 aa27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 KDELR3O43731 214 aa27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PTPRCAPQ14761 206 aa27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 RNF111Q6ZNA4 994 aa27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa27.67■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CRTAMO95727 393 aa27.66■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 EFEMP2O95967 443 aa27.66■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CD1DP15813 335 aa27.66■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 OXCT1P55809 520 aa27.66■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 CDC16Q13042 620 aa27.66■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 SEMA3AQ14563 771 aa27.66■■■□□ 2.02
CERS1-201ENST00000429504 PIGGQ5H8A4 983 aa27.66■■■□□ 2.02
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