RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415046.6

PTPRK-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 1,029 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-209ENST00000415046 CFHR3Q02985 330 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ARHGEF7Q14155 803 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 TFDP1Q14186 410 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KLHL22Q53GT1 634 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 HYIQ5T013 277 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RINT1Q6NUQ1 792 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 Q7L0L9 218 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RPAINQ86UA6 219 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ZNF410Q86VK4 478 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 HERC6Q8IVU3 1022 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DEPTORQ8TB45 409 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KCNG4Q8TDN1 519 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 IGFBPL1Q8WX77 278 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 APBB2Q92870 758 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 DHX58Q96C10 678 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 IFT74Q96LB3 600 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 HS6ST2Q96MM7 605 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 KIFC3Q9BVG8 833 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 APOL6Q9BWW8 343 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CCSER1Q9C0I3 900 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 CERS4Q9HA82 394 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ERVK-5Q9HDB9 667 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 SACM1LQ9NTJ5 587 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 AFF4Q9UHB7 1163 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 RIMKLBQ9ULI2 386 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MAFFQ9ULX9 164 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 L1RE1Q9UN81 338 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 LAMA3Q16787 3333 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 MYO10Q9HD67 2058 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRK-209ENST00000415046 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 A0A1B0GVL5 298 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 A0A1W2PPC1 479 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 A8MVJ9 347 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 K7ENM7 598 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 AGPSO00116 658 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SLC16A4O15374 487 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ASAP2O43150 1006 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 B4GALT5O43286 388 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RASSF9O75901 435 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PIAS2O75928 621 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 OAZ2O95190 189 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CSPG5O95196 566 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CA3P07451 260 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 HARSP12081 509 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 IDEP14735 1019 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 BRAFP15056 766 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PFKFB1P16118 471 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SCP2P22307 547 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CASP1P29466 404 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ARL2P36404 184 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 PGDP52209 483 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SLC12A3P55017 1021 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RPS13P62277 151 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MBTD1Q05BQ5 628 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 LEXMQ3ZCV2 418 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RESP18Q5W5W9 173 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ATL3Q6DD88 541 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DAW1Q8N136 415 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 FSIP1Q8NA03 581 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 USP38Q8NB14 1042 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 KIFAP3Q92845 792 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CPB2Q96IY4 423 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 HIC2Q96JB3 615 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 YME1L1Q96TA2 773 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 REEP2Q9BRK0 252 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ADGRE3Q9BY15 652 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 ARNT2Q9HBZ2 717 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TMEM184CQ9NVA4 438 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CHMP5Q9NZZ3 219 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 RCOR1Q9UKL0 485 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 MTUS1Q9ULD2 1270 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 SZT2Q5T011 3432 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 DENND4CQ5VZ89 1909 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 CFAP69A5D8W1 941 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 TSPAN1O60635 241 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRK-209ENST00000415046 GJB5O95377 273 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms