RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412640.6

SOX9-AS1-201, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 635 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SMAPO00193 183 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MTSS1O43312 755 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RBP3P10745 1247 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RARGP13631 454 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC5A2P31639 672 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HTR7P34969 479 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADCY8P40145 1251 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARL4AP40617 200 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PGFP49763 221 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DYNLT1P63172 113 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DPYSQ14117 519 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MORF4L2Q15014 288 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EFHC2Q5JST6 749 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CFAP58Q5T655 872 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF276Q8N554 614 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OR4C6Q8NH72 309 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SSC4DQ8WTU2 575 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 MIB2Q96AX9 1013 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HAUS1Q96CS2 278 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZIM3Q96PE6 472 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TMEM121Q9BTD3 319 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PHACTR1Q9C0D0 580 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 USP29Q9HBJ7 922 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DDIT4Q9NX09 232 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLIC5Q9NZA1 410 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SERGEFQ9UGK8 458 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ANAPC5Q9UJX4 755 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CLEC4EQ9ULY5 219 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NFS1Q9Y697 457 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBN3Q75N90 2809 aa9.65□□□□□ -0.86
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HACD1B0YJ81 288 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 H3BQF6 201 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 I6L893 689 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IRAK2O43187 625 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NUDT17P0C025 328 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 DGKAP23743 735 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GGCXP38435 758 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 UQCRFS1P47985 274 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PSEN1P49768 467 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ITGA8P53708 1063 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PMS2P54278 862 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZBTB16Q05516 673 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NME3Q13232 169 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 KCNAB2Q13303 367 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FHL5Q5TD97 284 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FYB2Q5VWT5 728 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IZUMO3Q5VZ72 239 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 NPNTQ6UXI9 565 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C4orf22Q6V702 233 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PCGF5Q86SE9 256 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 C14orf80Q86SX3 495 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TAC4Q86UU9 113 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HOOK3Q86VS8 718 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ATCAYQ86WG3 371 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 GLIS1Q8NBF1 620 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 IFI44Q8TCB0 444 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 RNF139Q8WU17 664 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 APOLD1Q96LR9 279 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 OLFM3Q96PB7 478 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 HAPLN3Q96S86 360 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ADNPQ9H2P0 1102 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 EPB41L4BQ9H329 900 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 PRSS16Q9NQE7 514 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FBXL12Q9NXK8 326 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SHOC2Q9UQ13 582 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 LRRK1Q38SD2 2015 aa9.64□□□□□ -0.87
SOX9-AS1-201ENST00000412640 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.2 ms