RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396039.1

PARD6B-202, Transcript of par-6 family cell polarity regulator beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PARD6B, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6B-202ENST00000396039 RGRP47804 291 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 SCNN1BP51168 640 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PEX6Q13608 980 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 CERCAMQ5T4B2 595 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 FAM46DQ8NEK8 389 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 TAS2R14Q9NYV8 317 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PCSK1NQ9UHG2 260 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 RABGEF1Q9UJ41 708 aa22.17■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 TMEM191CA6NGB0 347 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 MYBL1P10243 752 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 MIPP30301 263 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ARHGEF7Q14155 803 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ZNF235Q14590 738 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 LBRQ14739 615 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 NCAPHQ15003 741 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 CA9Q16790 459 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 FILIP1LQ4L180 1135 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 C14orf28Q4W4Y0 310 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 JAMLQ86YT9 394 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PLA2G15Q8NCC3 412 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 MED8Q96G25 268 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 FGF22Q9HCT0 170 aa22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 A0A1W2PQM1 296 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 TMEM202A6NGA9 273 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 H3BRJ5 948 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 NVLO15381 856 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PRKCGP05129 697 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 SLC5A2P31639 672 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ARL4AP40617 200 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ACOX1Q15067 660 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 TCEA2Q15560 299 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 ASIC2Q16515 512 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PNCKQ6P2M8 343 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 XKR5Q6UX68 686 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 NSMCE1Q8WV22 266 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 NUS1Q96E22 293 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PEBP4Q96S96 227 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 CMKLR1Q99788 373 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 FOXP3Q9BZS1 431 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 DPEP2Q9H4A9 486 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 SEPT10Q9P0V9 454 aa22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
PARD6B-202ENST00000396039 PRSS38A1L453 326 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 PMS2P1A4D2B8 440 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 LRRC53A6NM62 1247 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 J3QKU1 62 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 NOBOXO60393 691 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 MBD3O95983 291 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 PCK1P35558 622 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 SPRED1Q7Z699 444 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 AOPEPQ8N6M6 819 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 NPWQ8N729 165 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 HSD3B7Q9H2F3 369 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 CYP4F12Q9HCS2 524 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 LRIT1Q9P2V4 623 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 LOXL2Q9Y4K0 774 aa22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 B4DGG1 531 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 PSMD11O00231 422 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 LRCH4O75427 683 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 FTLP02792 175 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 LIPCP11150 499 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 KRT10P13645 584 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 CD82P27701 267 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 SERPINB6P35237 376 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 PRKCIP41743 596 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.134e-7■■□□□ 13.7
PARD6B-202ENST00000396039 DPYSQ14117 519 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 TMCO3Q6UWJ1 677 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 ZNF653Q96CK0 615 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 GSDMCQ9BYG8 508 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 B3GNT4Q9C0J1 378 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 TMEM168Q9H0V1 697 aa22.13■■□□□ 1.13
PARD6B-202ENST00000396039 HAUS4Q9H6D7 363 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms