RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395322.3

CTXN3-202, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-202ENST00000395322 AGAP9Q5VTM2 703 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LIPMQ5VYY2 423 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 NCEH1Q6PIU2 408 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 BBS7Q8IWZ6 715 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TTC16Q8NEE8 873 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LPCAT1Q8NF37 534 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 OR4L1Q8NH43 312 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FIBINQ8TAL6 211 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 KLHL29Q96CT2 875 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC126Q96EE4 140 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TBATAQ96M53 351 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 POPDC3Q9HBV1 291 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 OXSMQ9NWU1 459 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LHX3Q9UBR4 397 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ARL5AQ9Y689 179 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HIDE1A8MVS5 230 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ANKRD66B4E2M5 251 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 G3V2L1 256 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HGSO14964 777 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC22O60826 627 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HSPA4LO95757 839 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 IGSF6O95976 241 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GOT2P00505 430 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 POU2F2P09086 479 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RBP1P09455 135 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LPOP22079 712 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PSMA3P25788 255 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PMLP29590 882 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINB5P36952 375 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CSNK1DP48730 415 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 NUMBP49757 651 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ARSDP51689 593 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF140P52738 457 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 EPHB1P54762 984 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TAS2R39P59534 338 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RPL26P61254 145 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZXDBP98169 803 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TYSND1Q2T9J0 566 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GPR158Q5T848 1215 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HECTD2Q5U5R9 776 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 FAM91A1Q658Y4 838 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CNSTQ6PJW8 725 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LINGO4Q6UY18 593 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CLNKQ7Z7G1 428 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CMTM8Q8IZV2 173 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TNS4Q8IZW8 715 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ACVR1CQ8NER5 493 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 KCTD4Q8WVF5 259 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 INPP5DQ92835 1189 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SKA1Q96BD8 255 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ALG14Q96F25 216 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SAMD11Q96NU1 681 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 TCF12Q99081 682 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 OMDQ99983 421 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 C19orf43Q9BQ61 176 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PRR14Q9BWN1 585 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SLC46A2Q9BY10 475 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC68Q9H2F9 335 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 KCNK13Q9HB14 408 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 GPAMQ9HCL2 828 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 MAN1C1Q9NR34 630 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ZNF358Q9NW07 568 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 XPR1Q9UBH6 696 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 HEY2Q9UBP5 337 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SORCS3Q9UPU3 1222 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 VWA7Q9Y334 891 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 ACTL7AQ9Y615 435 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CCDC162PA2VCL2 907 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LCHNA4D1U4 455 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LINC01553A4QN01 128 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SOCS5O75159 536 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 CD160O95971 181 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 S1PR4O95977 384 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 F7P08709 466 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 SERPINB3P29508 390 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 STC1P52823 247 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-202ENST00000395322 PLK1P53350 603 aa11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms