RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391266.1

RNU6-1254P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1254, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1254P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KCNJ9Q92806 393 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ERGIC1Q969X5 290 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RNF183Q96D59 192 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARHGEF26Q96DR7 871 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NEUROD6Q96NK8 337 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LAT2Q9GZY6 243 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BTBD1Q9H0C5 482 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC25A18Q9H1K4 315 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACAD9Q9H845 621 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C17orf75Q9HAS0 396 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CYSLTR2Q9NS75 346 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC52A1Q9NWF4 448 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ADPRHL2Q9NX46 363 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ACAD8Q9UKU7 415 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CA14Q9ULX7 337 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AMDHD2Q9Y303 409 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MOB4Q9Y3A3 225 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRAG1Q86YV5 1406 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MYH15Q9Y2K3 1946 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ANO9A1A5B4 782 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM234BA2RU67 622 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EPM2AB3EWF7 344 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SYN3O14994 580 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SLC22A2O15244 555 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MGEA5O60502 916 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CTSVO60911 334 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RGS11O94810 467 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LARGE1O95461 756 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CBX6O95503 412 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NADKO95544 446 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 HRGP04196 525 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TFPIP10646 304 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ITGAXP20702 1163 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PEX2P28328 305 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PTPN9P43378 593 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF543Q08ER8 600 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RPE65Q16518 533 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KIAA0753Q2KHM9 967 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 SOWAHAQ2M3V2 549 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 C2CD6Q53TS8 623 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RINT1Q6NUQ1 792 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RGMBQ6NW40 437 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BEND5Q7L4P6 421 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 GALNT7Q86SF2 657 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MARCH9Q86YJ5 346 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TMTC1Q8IUR5 882 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BRSK2Q8IWQ3 736 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZMIZ2Q8NF64 920 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CEP70Q8NHQ1 597 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MRGPRDQ8TDS7 321 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 WDR60Q8WVS4 1066 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PHKBQ93100 1093 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRAC1Q96KF2 57 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PCYT2Q99447 389 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KXD1Q9BQD3 176 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 LRRC61Q9BV99 259 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CERS4Q9HA82 394 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 PRDM8Q9NQV8 689 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 CNGB3Q9NQW8 809 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZIM2Q9NZV7 527 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLHL42Q9P2K6 505 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KLQ9UEF7 1012 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NDRG3Q9UGV2 375 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 POMT2Q9UKY4 750 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NFU1Q9UMS0 254 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 RCE1Q9Y256 329 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARID1AO14497 2285 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 STK36Q9NRP7 1315 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 A0A1W2PPC4 97 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 ARHGAP10A1A4S6 786 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 OR6C68A6NDL8 312 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM90A18PA6NE21 464 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-1254P-201ENST00000391266 FAM90A16PA6NEW6 464 aa0.42□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.6 ms