RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375023.3

NOTCH4-201, Transcript of notch 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOTCH4, Length 6,745 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH4-201ENST00000375023 RGS1Q08116 209 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 IL17AQ16552 155 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FIGNQ5HY92 759 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PGBD2Q6P3X8 592 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FNDC11Q9BVV2 318 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 VPS4AQ9UN37 437 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 H3BMM5 538 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TNFAIP8O95379 198 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC35G4P0C7Q5 338 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GNSP15586 552 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MED22Q15528 200 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF549Q6P9A3 640 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ATG14Q6ZNE5 492 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KATNAL2Q8IYT4 538 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 LMLNQ96KR4 655 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CDADC1Q9BWV3 514 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GDF3Q9NR23 364 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 STARD13Q9Y3M8 1113 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A1W2PPM1 405 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ULK1O75385 1050 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ARMC3Q5W041 872 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ADHFE1Q8IWW8 467 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 STK40Q8N2I9 435 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TERB1Q8NA31 727 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SUN3Q8TAQ9 357 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ART5Q96L15 291 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CLN6Q9NWW5 311 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CLIC5Q9NZA1 410 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 LRCH1Q9Y2L9 728 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 COX4I1P13073 169 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 UQCRBP14927 111 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FUT4P22083 530 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MAPK8P45983 427 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ERVK-21P61565 698 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ECM1Q16610 540 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SETD9Q8NE22 299 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ATL1Q8WXF7 558 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ATP4AP20648 1035 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CPA6Q8N4T0 437 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 BAP1Q92560 729 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 A0A075B6Q4 140 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FAM92AA1XBS5 289 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ADCY6O43306 1168 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GUCY1B2O75343 617 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 NRLP54845 237 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ADRM1Q16186 407 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CREG2Q8IUH2 290 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GHDCQ8N2G8 530 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RCN3Q96D15 328 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MAML3Q96JK9 1138 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OR52E6Q96RD3 313 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GAL3ST1Q99999 423 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PSMG1O95456 288 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RAB10P61026 200 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 EEF1DP3Q658K8 133 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SGK2Q9HBY8 427 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PSME2Q9UL46 239 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PTPRJQ12913 1337 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TAF4O00268 1085 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CXCR2P25025 360 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 C2orf27AQ580R0 203 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PMF1Q6P1K2 205 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 SLC47A1Q96FL8 570 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 PAGE1O75459 146 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 KRT36O76013 467 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TIE1P35590 1138 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CYP2S1Q96SQ9 504 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 XPR1Q9UBH6 696 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CNTNAP1P78357 1384 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 MT-ND1P03886 318 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 INHAP05111 366 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 CDC42P60953 191 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 ST3GAL1Q11201 340 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 GK5Q6ZS86 529 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 RNF157Q96PX1 679 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH4-201ENST00000375023 HBEGFQ99075 208 aa14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms