RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 RAD51Q06609 339 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 POU6F1Q14863 301 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TERF2Q15554 542 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CRY1Q16526 586 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SYT13Q7L8C5 426 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM135Q86UB9 458 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TRABD2AQ86V40 505 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC26A11Q86WA9 606 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 OR8D1Q8WZ84 308 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM129BQ96TA1 746 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CHRAC1Q9NRG0 131 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 IL36AQ9UHA7 158 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 WASF2Q9Y6W5 498 aa20.11■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 UGT1A9O60656 530 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM155BO75949 473 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SERPINF2P08697 491 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PCID2Q5JVF3 399 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 UGT1A7Q9HAW7 530 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 UGT1A10Q9HAW8 530 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 UGT1A8Q9HAW9 530 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ARNT2Q9HBZ2 717 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MYLKQ15746 1914 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 LEFTY1O75610 366 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PIGNO95427 931 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 COPAP53621 1224 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 GUCY1A3Q02108 690 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MTAPQ13126 283 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ARSIQ5FYB1 569 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SPEM1Q8N4L4 309 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 OR2T3Q8NH03 318 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MDM1Q8TC05 714 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MFSD3Q96ES6 412 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CERS2Q96G23 380 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 KIFC1Q9BW19 673 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SARDHQ9UL12 918 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PPM1HQ9ULR3 514 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ACTL7BQ9Y614 415 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM169AQ9Y6X4 670 aa20.1■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC78A2IDD5 438 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 BRAFP15056 766 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 NMBRP28336 390 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MAGEA9P43362 315 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CLCN5P51795 746 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MGAT5Q09328 741 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 GRM3Q14832 879 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC1A5Q15758 541 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 DSG4Q86SJ6 1040 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 RASSF3Q86WH2 238 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CAMK1DQ8IU85 385 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CDKL2Q92772 493 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 IFT43Q96FT9 208 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TRABDQ9H4I3 376 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 EPHX3Q9H6B9 360 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 FBRSQ9HAH7 460 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC17A6Q9P2U8 582 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa20.09■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 A0A1W2PPM1 405 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 IL1BP01584 269 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PRNPP04156 253 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 UGT2B4P06133 528 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ERVK-10P10266 1014 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MDH1P40925 334 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 DGKEP52429 567 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 GNGT1P63211 74 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SATB1Q01826 763 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 CDK18Q07002 472 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 BCL2L1Q07817 233 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SEPT6Q14141 434 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 TMIEQ8NEW7 156 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 MZB1Q8WU39 189 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PBXIP1Q96AQ6 731 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 FEM1CQ96JP0 617 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNF778Q96MU6 729 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 IER2Q9BTL4 223 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNK9Q9NPC2 374 aa20.08■□□□□ 0.81
RALGPS1-204ENST00000373436 PSD3Q9NYI0 1048 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms