RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 MYL3P08590 195 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GPX3P22352 226 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SLC6A2P23975 617 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 YWHAQP27348 245 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GP2P55259 537 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CYHR1Q6ZMK1 362 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 C14orf80Q86SX3 495 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 RNF38Q9H0F5 515 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 POMKQ9H5K3 350 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TBC1D14Q9P2M4 693 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SIX4Q9UIU6 781 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ACOT9Q9Y305 439 aa21.81■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 KRT19P08727 400 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 IL7RP16871 459 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GLUD2P49448 558 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP21.8■■□□□ 1.083e-7■□□□□ 8.4
OPN3-201ENST00000366554 NETO2Q8NC67 525 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 OR7A2PQ8NGA2 310 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GPRASP2Q96D09 838 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 C17orf80Q9BSJ5 609 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NADKO95544 446 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MTHFD1P11586 935 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ITIH1P19827 911 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CD40LGP29965 261 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 RGS7P49802 495 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PHC1P78364 1004 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 LAMC2Q13753 1193 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CAPSQ13938 189 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PYCR3Q53H96 274 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SLC26A9Q7LBE3 791 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SPATA6LQ8N4H0 392 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SLC30A3Q99726 388 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 BTBD2Q9BX70 525 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 LY75O60449 1722 aa21.8■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 FAM172BPA6NC97 362 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MFSD11O43934 449 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MSCO60682 206 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 INMTO95050 263 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PARNO95453 639 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PGK1P00558 417 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GOT1P17174 413 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PPP5CP53041 499 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ADPRMQ3LIE5 342 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 IQCF2Q8IXL9 164 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 HTRA1Q92743 480 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 VPS33AQ96AX1 596 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 BCL7BQ9BQE9 202 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TLL2Q9Y6L7 1015 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NEMP2A6NFY4 417 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 G3V3G9 751 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 B4GALT4O60513 344 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 KCNK2O95069 426 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ARSFP54793 590 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 GABARAPL2P60520 117 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PIGFQ07326 219 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ZNF460Q14592 562 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 DGUOKQ16854 277 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 BTBD8Q5XKL5 378 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 VSIG10LQ86VR7 867 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TMEM130Q8N3G9 435 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NAT16Q8N8M0 369 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NDNFQ8TB73 568 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CASS4Q9NQ75 786 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SEPT10Q9P0V9 454 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ANAPC2Q9UJX6 822 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.79■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 A0A0J9YYE9 177 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 ISPDA4D126 451 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PCMT1P22061 227 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SLC6A3Q01959 620 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 BST2Q10589 180 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 UGT3A2Q3SY77 523 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 LCLAT1Q6UWP7 414 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 NT5DC4Q86YG4 428 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 RHOXF1Q8NHV9 184 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 TSPAN16Q9UKR8 245 aa21.78■■□□□ 1.08
OPN3-201ENST00000366554 PDE10AQ9Y233 779 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms