RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 HADHAP40939 763 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GPD2P43304 727 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ABCG1P45844 678 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OCA2Q04671 838 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ST3GAL2Q16842 350 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-BQ31612 363 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FAM171BQ6P995 826 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 BRAT1Q6PJG6 821 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CNSTQ6PJW8 725 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZVL8 140 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FIBINQ8TAL6 211 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF398Q8TD17 642 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RAB7BQ96AH8 199 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MED8Q96G25 268 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LRIG1Q96JA1 1093 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LMLNQ96KR4 655 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C12orf66Q96MD2 445 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SRMSQ9H3Y6 488 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 COG4Q9H9E3 785 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PCDH9Q9HC56 1237 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MRFAP1Q9Y605 127 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ARID2Q68CP9 1835 aa4.46□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 DOCK8Q8NF50 2099 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FLRT2O43155 660 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CATP04040 527 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GFAPP14136 432 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 L1CAMP32004 1257 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RAP1GDS1P52306 607 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NOMO3P69849 1222 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF805Q5CZA5 627 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP40Q5TG30 622 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FAAH2Q6GMR7 532 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MICALCLQ6ZW33 695 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM74Q86UV6 250 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PYROXD2Q8N2H3 581 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TPCN2Q8NHX9 752 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 WDR48Q8TAF3 677 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KRT35Q92764 455 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IL21RQ9HBE5 538 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ABI3Q9P2A4 366 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ITM2BQ9Y287 266 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.45□□□□□ -1.7
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PTPRC-201ENST00000348564 DUX1O43812 170 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SCNN1AP37088 669 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ARSEP51690 589 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NR0B2Q15466 257 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 ZBTB6Q15916 424 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CTC1Q2NKJ3 1217 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KIF19Q2TAC6 998 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PKN3Q6P5Z2 889 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CHMP1BQ7LBR1 199 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 AMZ2Q86W34 360 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC49Q8IUZ0 686 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FRMD1Q8N878 549 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IL17RCQ8NAC3 791 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CHST14Q8NCH0 376 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 BBOF1Q8ND07 529 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 FNIP1Q8TF40 1166 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VCPIP1Q96JH7 1222 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TGM7Q96PF1 710 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 IER2Q9BTL4 223 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 XYLT2Q9H1B5 865 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PIGVQ9NUD9 493 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 OR1A2Q9Y585 309 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 NCANO14594 1321 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TTC3P53804 2025 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 GABRDO14764 452 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 MTX2O75431 263 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 PROSCO94903 275 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 TCN2P20062 427 aa4.45□□□□□ -1.7
PTPRC-201ENST00000348564 CES1P23141 567 aa4.45□□□□□ -1.7
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