RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC25A13Q9UJS0 675 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GGA2Q9UJY4 613 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CLEC4EQ9ULY5 219 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RPL26L1Q9UNX3 145 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC8A2Q9UPR5 921 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa10.17□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC78A2IDD5 438 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SIN3BO75182 1162 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ASMTLO95671 621 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 IGSF6O95976 241 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PRLP01236 227 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MPOP05164 745 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PABPC1P11940 636 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NEFHP12036 1026 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HLA-FP30511 346 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CRHR1P34998 444 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LIMK2P53671 638 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB15P59190 212 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BCL2L1Q07817 233 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BMPR2Q13873 1038 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 IHHQ14623 411 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GRM3Q14832 879 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 INSCQ1MX18 579 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ACCSLQ4AC99 568 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ARMC12Q5T9G4 340 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FSTL4Q6MZW2 842 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LVRNQ6Q4G3 990 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RNF135Q8IUD6 432 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GDAP1Q8TB36 358 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 BPIFB1Q8TDL5 484 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 OSCP1Q8WVF1 389 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LMLNQ96KR4 655 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RHOJQ9H4E5 214 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MLXIPLQ9NP71 852 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 OBP2AQ9NY56 170 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LHX3Q9UBR4 397 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TLK1Q9UKI8 766 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HS3ST2Q9Y278 367 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PLLPQ9Y342 182 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PSAT1Q9Y617 370 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 WNT6Q9Y6F9 365 aa10.16□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRSQ13332 1948 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HMX2A2RU54 273 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA8TH3BQL2 631 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 PFDN6O15212 129 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LDB2O43679 373 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GJB3O75712 270 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 NFATC1O95644 943 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 POP4O95707 220 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GLP2RO95838 553 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 AHSGP02765 367 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LPOP22079 712 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SERPINB8P50452 374 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ECT2LQ008S8 904 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GALNT3Q14435 633 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GRIN2CQ14957 1233 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 DHCR24Q15392 516 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM78AQ5JUQ0 283 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE3BQ5TA77 95 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CES5AQ6NT32 575 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MRNIPQ6NTE8 343 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM42Q8IWZ5 723 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TDHQ8IZJ6 230 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 OTUD6BQ8N6M0 293 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 EFHBQ8N7U6 833 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LPCAT1Q8NF37 534 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 OR2AP1Q8NGE2 309 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC8CQ8TDW0 803 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FGF13Q92913 245 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 HDAC10Q969S8 669 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TSNARE1Q96NA8 513 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB16Q96NS5 453 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 CEP44Q9C0F1 390 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM107BQ9H098 131 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MFSD1Q9H3U5 465 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 ZFP14Q9HCL3 533 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 MKS1Q9NXB0 559 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa10.15□□□□□ -0.78
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO5Q9UKT4 447 aa10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms