RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA8L1Q5VT79 327 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HPS6Q86YV9 775 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CXorf40AQ8TE69 158 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HDAC10Q969S8 669 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC28Q9NX36 388 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 VWA7Q9Y334 891 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FTH1P02794 183 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 HECTD3Q5T447 861 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 NMUR2Q9GZQ4 415 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH22Q9UJ99 828 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT2B11O75310 529 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL4P36578 427 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPGP40121 348 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 MARSP56192 900 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa24.21■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC162PA2VCL2 907 aa24.2■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 LRIG2O94898 1065 aa24.2■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 IQSEC1Q6DN90 963 aa24.2■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXR2Q6PJQ5 311 aa24.2■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 PIH1D2Q8WWB5 315 aa24.2■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRE2Q9UHX3 823 aa24.2■■□□□ 1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 TBL1XO60907 577 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNYL3P0C7X3 344 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ECM1Q16610 540 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AGMOQ6ZNB7 445 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 VGLL2Q8N8G2 317 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 NETO2Q8NC67 525 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDHB18PQ96TA0 734 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH18Q9HCL0 1135 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PRDM8Q9NQV8 689 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CAPN8A6NHC0 703 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 HNMTP50135 292 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TIGD2Q4W5G0 525 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD5Q6N075 450 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM40Q6P9F5 258 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA19Q7Z5L4 167 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CLPTM1LQ96KA5 538 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 COX4I2Q96KJ9 171 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MFSD14AQ96MC6 490 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 LPOP22079 712 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ECHDC2Q86YB7 292 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C12orf29Q8N999 325 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 JOSD2Q8TAC2 188 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 P2RY11Q96G91 374 aa24.2■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TGFB1I1O43294 461 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TM7SF2O76062 418 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINA1P01009 418 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BEX3Q00994 111 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ABRQ12979 859 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SPPL2CQ8IUH8 684 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 TM6SF2Q9BZW4 377 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FADS3Q9Y5Q0 445 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 XYLBO75191 536 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM155BO75949 473 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 S100A9P06702 114 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MTTPP55157 894 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH13P55290 713 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF220Q5VTB9 566 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 OR2T12Q8NG77 320 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SPACA7Q96KW9 195 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 YDJCA8MPS7 323 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RIPK1Q13546 671 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 DLG2Q15700 870 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD5Q16401 504 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 DACT2Q5SW24 774 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 POTEHQ6S545 545 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ING3Q9NXR8 418 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB26Q9ULW5 256 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP7P18075 431 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 ABATP80404 500 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 BNIP1Q12981 228 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 MCFD2Q8NI22 146 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 COPS5Q92905 334 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA5AQ13591 1074 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC1A5Q15758 541 aa24.19■■□□□ 1.46
GNPTAB-201ENST00000299314 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms