RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299238.6

HPS6-201, Transcript of HPS6, biogenesis of lysosomal organelles complex 2 subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene HPS6, Length 2,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS6-201ENST00000299238 M0QZQ0 153 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 SLC10A3P09131 477 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 TRIM32Q13049 653 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 HIPK3Q9H422 1215 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 MYRFQ9Y2G1 1151 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 ARHGEF37A1IGU5 675 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 PFDN6O15212 129 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ITGB1P05556 798 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 TUSC3Q13454 348 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 ADAM2Q99965 735 aa20.23■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 H3BMQ9 156 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 NMRK2Q9NPI5 230 aa20.23■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 SEPT4O43236 478 aa20.22■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa20.22■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 TMEM79Q9BSE2 394 aa20.22■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa20.22■□□□□ 0.83
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HPS6-201ENST00000299238 AP3B1O00203 1094 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 DNAJB2P25686 324 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 NAGLUP54802 743 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 TSPY1Q01534 308 aa20.21■□□□□ 0.83
HPS6-201ENST00000299238 CTBP1Q13363 440 aa20.21■□□□□ 0.83
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