RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000290130.3

MIS18A-201, Transcript of MIS18 kinetochore protein A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MIS18A, Length 1,575 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18A-201ENST00000290130 TUBB4BP68371 445 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ELP6Q0PNE2 266 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 MSS51Q4VC12 460 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 LRRC66Q68CR7 880 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 MPP5Q8N3R9 675 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 UBXN4Q92575 508 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 EID2BQ96D98 161 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 BTBD1Q9H0C5 482 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ZNF711Q9Y462 761 aa21.95■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PRR23AA6NEV1 266 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 NEMP1O14524 444 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 NDC80O14777 642 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 BANF1O75531 89 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CLDN7O95471 211 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SLC4A1P02730 911 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 MGAT1P26572 445 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CNGA3Q16281 694 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CCDC38Q502W7 563 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 IFT20Q8IY31 132 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 FBXO4Q9UKT5 387 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ARL5AQ9Y689 179 aa21.94■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PCDH8O95206 1070 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CD6P30203 668 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CAV1Q03135 178 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PTSQ03393 145 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SGK2Q9HBY8 427 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SYBUQ9NX95 663 aa21.93■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 THADAQ6YHU6 1953 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3EA0A087X179 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 GOLGA8CPA6NN73 597 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3LB9A6J9 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TSPAN6O43657 245 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SEMA4FO95754 770 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3HP0C7X1 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 NFKBIAP25963 317 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 OXTRP30559 389 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 LIG3P49916 1009 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 HIF1AQ16665 826 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 LIPIQ6XZB0 460 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TTC30BQ8N4P2 665 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.92■■□□□ 1.17e-8■■□□□ 14.5
MIS18A-201ENST00000290130 BFARQ9NZS9 450 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 KCTD3Q9Y597 815 aa21.92■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 AP3B1O00203 1094 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 LDB2O43679 373 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 MMP20O60882 483 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ELFN1P0C7U0 828 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 NPY2RP49146 381 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PPP2CBP62714 309 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PPP2CAP67775 309 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CUL1Q13616 776 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SEPT6Q14141 434 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ARHGEF7Q14155 803 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PTPRCAPQ14761 206 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ANGPT1Q15389 498 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PDIK1LQ8N165 341 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SIGLEC10Q96LC7 697 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 GPR174Q9BXC1 333 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 IL22Q9GZX6 179 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 KDM4CQ9H3R0 1056 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 TRABDQ9H4I3 376 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 PREBQ9HCU5 417 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 HACD3Q9P035 362 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 NFU1Q9UMS0 254 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 SPAG17Q6Q759 2223 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 CCDC78A2IDD5 438 aa21.91■■□□□ 1.1
MIS18A-201ENST00000290130 H0Y858 1186 aa21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.1 ms