RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000288022.1

PDF-201, Transcript of peptide deformylase, mitochondrial, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDF, Length 1,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDF-201ENST00000288022 NPIPB15A6NHN6 443 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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PDF-201ENST00000288022 PTPN3P26045 913 aa25.21■■□□□ 1.63
PDF-201ENST00000288022 ATP5OP48047 213 aa25.21■■□□□ 1.63
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PDF-201ENST00000288022 CCZ1BP86790 482 aa25.21■■□□□ 1.63
PDF-201ENST00000288022 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
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PDF-201ENST00000288022 COQ10AQ96MF6 247 aa25.19■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa25.17■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
PDF-201ENST00000288022 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
PDF-201ENST00000288022 LRRC66Q68CR7 880 aa25.17■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 MACC1Q6ZN28 852 aa25.17■■□□□ 1.62
PDF-201ENST00000288022 PID1Q7Z2X4 250 aa25.17■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 SPATA22Q8NHS9 363 aa25.17■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 HTR1BP28222 390 aa25.16■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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PDF-201ENST00000288022 ALS2CR12Q96Q35 445 aa25.16■■□□□ 1.62
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