RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000277657.12

CCDC7-201, Transcript of coiled-coil domain containing 7, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC7, Length 1,899 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7-201ENST00000277657 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OR2AP1Q8NGE2 309 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OR6K2Q8NGY2 324 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 VOPP1Q96AW1 172 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PLCD4Q9BRC7 762 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SLC2A11Q9BYW1 496 aa22.12■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OGNP20774 298 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ALDH3A1P30838 453 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ABL2P42684 1182 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SULT2A1Q06520 285 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 BCL2L1Q07817 233 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 BST1Q10588 318 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 GPATCH11Q8N954 259 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TNKS2Q9H2K2 1166 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 MAGEE1Q9HCI5 957 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CATSPERZQ9NTU4 200 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 COPG2Q9UBF2 871 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TYSND1Q2T9J0 566 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 MBLAC2Q68D91 279 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 AFTPHQ6ULP2 937 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ADIPOR2Q86V24 386 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PNPLA1Q8N8W4 532 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 RSPRY1Q96DX4 576 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CEP44Q9C0F1 390 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 DZANK1Q9NVP4 752 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 KLHL14Q9P2G3 628 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SLC25A13Q9UJS0 675 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ACOT9Q9Y305 439 aa22.11■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SNNO75324 88 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PIGNO95427 931 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TGDSO95455 350 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PGGT1BP53609 377 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 EPHB1P54762 984 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ECT2LQ008S8 904 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SEMA3AQ14563 771 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 C22orf39Q6P5X5 142 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 EFHBQ8N7U6 833 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 C7orf26Q96N11 449 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 GDF15Q99988 308 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 FBXO10Q9UK96 956 aa22.1■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CCT8L1PA6NM43 557 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OCRLQ01968 901 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF460Q14592 562 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PTPRRQ15256 657 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 DHCR24Q15392 516 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OSCP1Q8WVF1 389 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CCT6BQ92526 530 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 NDNQ99608 321 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 OLFM1Q99784 485 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 A0A087X1B8 175 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 H7C0S8 307 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 KIAA0754O94854 1291 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 APOA4P06727 396 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CPA3P15088 417 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 KCNA4P22459 653 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 GKP32189 559 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 STC1P52823 247 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 HECTD2Q5U5R9 776 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM151AQ8N4L1 468 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SLC28A3Q9HAS3 691 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF711Q9Y462 761 aa22.09■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 G3V2L1 256 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 CYP17A1P05093 508 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 VIPR2P41587 438 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 SLC12A2P55011 1212 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 MYLK3Q32MK0 819 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 EML3Q32P44 896 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TMEM215Q68D42 235 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 C10orf107Q8IVU9 208 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 AHI1Q8N157 1196 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ZNF398Q8TD17 642 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 KCTD4Q8WVF5 259 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 C10orf82Q8WW14 230 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 TSPAN17Q96FV3 270 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 ASB16Q96NS5 453 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 GPR78Q96P69 363 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 VWA7Q9Y334 891 aa22.08■■□□□ 1.13
CCDC7-201ENST00000277657 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms