RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PCCBP05166 539 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 FGF1P05230 155 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC63Q05C16 580 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 NME3Q13232 169 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 DENND1BQ6P3S1 775 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM71Q6P5X7 295 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ESX1Q8N693 406 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 KAT5Q92993 513 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 FBXO8Q9NRD0 319 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZGRF1Q86YA3 2104 aa16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PCSK5Q92824 1860 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa16.48■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 MAN1A1P33908 653 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 DLSTP36957 453 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SEMA5AQ13591 1074 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 GDPD4Q6W3E5 623 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 NRROSQ86YC3 692 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PLA2G15Q8NCC3 412 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PATE1Q8WXA2 126 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TSG101Q99816 390 aa16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1DO15297 605 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 HSF2BPO75031 334 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 POP4O95707 220 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 GLI1P08151 1106 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CCNB1P14635 433 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PGDP52209 483 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 GNA12Q03113 381 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 NFKBIBQ15653 356 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MEA1Q16626 185 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MYLK3Q32MK0 819 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 TP53INP2Q8IXH6 220 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 SMARCE1Q969G3 411 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PIGVQ9NUD9 493 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TAAR2Q9P1P5 351 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 KCND3Q9UK17 655 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CROTQ9UKG9 612 aa16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 CDC14CA4D256 554 aa16.46■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
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SPCS1-201ENST00000233025 PDCLQ13371 301 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 MCEMP1Q8IX19 187 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 NAGSQ8N159 534 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 TIGD1Q96MW7 591 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 LUZP4Q9P127 313 aa16.46■□□□□ 0.23
SPCS1-201ENST00000233025 PRSS38A1L453 326 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PMM2O15305 246 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SMC2O95347 1197 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CBX6O95503 412 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GPLD1P80108 840 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 NR6A1Q15406 480 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 BRMS1LQ5PSV4 323 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TTI2Q6NXR4 508 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LMO3Q8TAP4 145 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 MAN1B1Q9UKM7 699 aa16.45■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PSMA7O14818 248 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 KELP23276 732 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 VARSP26640 1264 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 ACVRL1P37023 503 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 STAT1P42224 750 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CXCR3P49682 368 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CPZQ66K79 652 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LRRC31Q6UY01 552 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 PPM1KQ8N3J5 372 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf74Q96LT6 269 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 CEP63Q96MT8 703 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 NT5C1BQ96P26 610 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GBP4Q96PP9 640 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 SLC25A23Q9BV35 468 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 LGR4Q9BXB1 951 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 GSDMCQ9BYG8 508 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 TWSG1Q9GZX9 223 aa16.44■□□□□ 0.22
SPCS1-201ENST00000233025 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
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