RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 C19orf60Q96EN9 201 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP13A1Q9HD20 1204 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 MAP10Q9P2G4 905 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 VWA7Q9Y334 891 aa22.21■■□□□ 1.15
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP10O43572 662 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PFDN1O60925 122 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 WNT3AP56704 352 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PRMT9Q6P2P2 845 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 C3orf30Q96M34 536 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 IRAK2O43187 625 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MYF6P23409 242 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6V0D1P61421 351 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 EML3Q32P44 896 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 UNC50Q53HI1 259 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM210AQ96ND0 272 aa22.2■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A087WXM4 84 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NME4O00746 187 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNC1P48547 511 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NME5P56597 212 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM207Q6UWW9 146 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 KDELC2Q7Z4H8 507 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ISCA2Q86U28 154 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CLYBLQ8N0X4 340 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MYLPFQ96A32 169 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM62Q9BVG3 475 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TRIM15Q9C019 465 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NDFIP2Q9NV92 336 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NDUFAF1Q9Y375 327 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PAGE1O75459 146 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SUPT7LO94864 414 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 HSD17B1P14061 328 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CDH15P55291 814 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MFSD10Q14728 455 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 DPP9Q86TI2 863 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CILP2Q8IUL8 1156 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM110BQ8TC76 370 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TINF2Q9BSI4 451 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 AKTIPQ9H8T0 292 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 OSER1Q9NX31 292 aa22.19■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 A0A0J9YYE9 177 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TREHO43280 583 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP6AP2O75787 350 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MYL3P08590 195 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NOMO2Q5JPE7 1267 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 OR13J1Q8NGT2 312 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC45A3Q96JT2 553 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SMOXQ9NWM0 555 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FGF4P08620 206 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PCSK1P29120 753 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GALK1P51570 392 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CLCNKBP51801 687 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 NUP107P57740 925 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 BNIP2Q12982 314 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ZBED5Q49AG3 693 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TBCELQ5QJ74 424 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 LCN8Q6JVE9 175 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 EPHX4Q8IUS5 362 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CBR4Q8N4T8 237 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 TNIP2Q8NFZ5 429 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R14BQ96C90 147 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FEM1CQ96JP0 617 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ALG9Q9H6U8 611 aa22.18■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC7A4O43246 635 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 MT-CO1P00395 513 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 HERVK_113P63132 956 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 RTP3Q9BQQ7 232 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ERVK-6Q9BXR3 956 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 DHRS12A0PJE2 317 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CDKN2DP55273 166 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 INPP5AQ14642 412 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR158Q5T848 1215 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM219BQ5XKK7 198 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 GPR141Q7Z602 305 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 CROCCP3Q8IVE0 287 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC15A3Q8IY34 581 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ITFG2Q969R8 447 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 LRCH3Q96II8 777 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 ASB2Q96Q27 587 aa22.17■■□□□ 1.14
HTATSF1-201ENST00000218364 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa22.17■■□□□ 1.14
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