RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000171887.8

TNS1-201, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 10,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-201ENST00000171887 DSELQ8IZU8 1212 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 XKR6Q5GH73 641 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TMCO6Q96DC7 493 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SYT15Q9BQS2 421 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CLUHO75153 1309 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LINC00032P0C843 101 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CARTPTQ16568 116 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FAM92BQ6ZTR7 304 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 AHSA2Q719I0 299 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DET1Q7L5Y6 550 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PANX1Q96RD7 426 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.29□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SLC37A4O43826 429 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ARMC12Q5T9G4 340 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 POTEHQ6S545 545 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FRRS1Q6ZNA5 592 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 HDAC7Q8WUI4 952 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CCDC107Q8WV48 283 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SLC22A3O75751 556 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ANXA5P08758 320 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 IGFBP5P24593 272 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CA9Q16790 459 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 RAB21Q9UL25 225 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PRKAB1Q9Y478 270 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PPEF2O14830 753 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PRMT3O60678 531 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MICAL2O94851 1124 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MSR1P21757 451 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MYL6P60660 151 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TTI2Q6NXR4 508 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 POF1BQ8WVV4 589 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SPG21Q9NZD8 308 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ARL5CA6NH57 179 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CSH1P0DML2 217 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CSH2P0DML3 217 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 KCNA5P22460 613 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TTMPQ5BVD1 217 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PPM1LQ5SGD2 360 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SNX20Q7Z614 316 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CHST4Q8NCG5 386 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NXNL1Q96CM4 212 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 C2orf71A6NGG8 1288 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CD86P42081 329 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CPTPQ5TA50 214 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CHST13Q8NET6 341 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 HM13Q8TCT9 377 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TATDN2Q93075 761 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PPP1R16AQ96I34 528 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PSMD9O00233 223 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SEC16AO15027 2179 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 CCNDBP1O95273 360 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SRCP12931 536 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NPTX2P47972 431 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NEPROQ6NW34 567 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 USP49Q70CQ1 688 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TMIEQ8NEW7 156 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SLC5A5Q92911 643 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 OTCP00480 354 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 PPIBP23284 216 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 FAM91A1Q658Y4 838 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TRIM74Q86UV6 250 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 TRIM73Q86UV7 250 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 SPATA20Q8TB22 786 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 VCPIP1Q96JH7 1222 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 MATN2O00339 956 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 DNTTP04053 509 aa9.28□□□□□ -0.92
TNS1-201ENST00000171887 IGFALSP35858 605 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.2 ms