RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000008440.9

SPRTN-201, Transcript of SprT-like N-terminal domain, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SPRTN, Length 1,667 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRTN-201ENST00000008440 CD6P30203 668 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 VIPR1P32241 457 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SUOXP51687 545 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CRADDP78560 199 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 RALGDSQ12967 914 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 USP39Q53GS9 565 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LRRC66Q68CR7 880 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 DPPA4Q7L190 304 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 FBXO25Q8TCJ0 367 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ART4Q93070 314 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MAGEE1Q9HCI5 957 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF711Q9Y462 761 aa21.43■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 AP1G1O43747 822 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 NFKBIAP25963 317 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MGAT1P26572 445 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 OXTRP30559 389 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CCDC38Q502W7 563 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 FNBP1LQ5T0N5 605 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ZDHHC24Q6UX98 284 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LYSMD1Q96S90 227 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LRFN3Q9BTN0 628 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 GPR174Q9BXC1 333 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SGK2Q9HBY8 427 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 FAM114A2Q9NRY5 505 aa21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MMP20O60882 483 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 BANF1O75531 89 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SEMA4FO95754 770 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CARSP49589 748 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LIG3P49916 1009 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ARHGEF7Q14155 803 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CNGA3Q16281 694 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CDKN3Q16667 212 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 WDR5BQ86VZ2 330 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LONP2Q86WA8 852 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 UBXN4Q92575 508 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 GPR63Q9BZJ6 419 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 GDF3Q9NR23 364 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 COQ6Q9Y2Z9 468 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ARL5AQ9Y689 179 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MYO15AQ9UKN7 3530 aa21.41■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CCDC78A2IDD5 438 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 DLL1O00548 723 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 TSPAN6O43657 245 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ELFN1P0C7U0 828 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 PPP2CBP62714 309 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 PPP2CAP67775 309 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 PTSQ03393 145 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SEPT6Q14141 434 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 TMEM52BQ4KMG9 183 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MSS51Q4VC12 460 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SEL1L3Q68CR1 1132 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LIPIQ6XZB0 460 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 IFT20Q8IY31 132 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MPP5Q8N3R9 675 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 DEFB119Q8N690 84 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 KLK6Q92876 244 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 EID2BQ96D98 161 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SPACA7Q96KW9 195 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SYBUQ9NX95 663 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 BFARQ9NZS9 450 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 LRRC72A6NJI9 287 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SMAPO00193 183 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 NDC80O14777 642 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 SP9P0CG40 484 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MLNP12872 115 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 BCKDHBP21953 392 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 PTPRCAPQ14761 206 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 OR2T34Q8NGX1 318 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 BRSK1Q8TDC3 778 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 PREBQ9HCU5 417 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 KCTD3Q9Y597 815 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 CACNA1HO95180 2353 aa21.4■■□□□ 1.02
SPRTN-201ENST00000008440 A0A1W2PQU0 124 aa21.39■■□□□ 1.01
SPRTN-201ENST00000008440 IGLON5A6NGN9 336 aa21.39■■□□□ 1.01
SPRTN-201ENST00000008440 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms